Влияние двух способов связывания лигандов на параметры перехода спираль - клубок ДНК

Abstract

Рассмотрена задача о переходе спираль — клубок в комплексах ДНК со скрепками для случая двух типов связывания, отличающихся друг от друга константами связывания лиганда с нативной ДНК. Получены формулы, связывающие экспериментально определяемые параметры кривой плавления комплексов ДНК со скрепками с параметрами теории. Показано, что формула для определения энтальпии плавления ДНК (ΔH) универсальна и справедлива при самых общих предположениях.

Розглянуто задачу про перехід спіраль-клубок у комплексах ДНК зі скріпками для випадку двох типів зв’язування, що відрізняються один від одного константами зв’язування ліганда з нативною ДНК. Отримано формули, що зв’язують експериментально визначені параметри кривої плавлення комплексів ДНК зі скріпками з параметрами теорії. Показано, що формула для визначення ентальпії плавлення ДНК (ΔH) універсальна і справедлива при найзагальніших припущеннях.

A theory of the helix-coil transition in DNA complexes with ligands is developed for the case of two types of interaction differing from each other in the binding constants of the ligand to the unmelted DNA. The formulas connecting the experimentally found parameters of the melting curves of the DNA-ligand complexes with the parameters of the theory are derived. It is shown that the formula for the enthalpy of the helix-coil transition of DNA (ΔH) is universal and valid at the very general assumptions.