Наукова електронна бібліотека
періодичних видань НАН України

DNA loop organization in glioblastoma T98G cells at their different functional states

Репозиторій DSpace/Manakin

Показати простий запис статті

dc.contributor.author Afanasieva, K.S.
dc.contributor.author Semenova, A.Y.
dc.contributor.author Lukash, L.L.
dc.contributor.author Sivolob, A.V.
dc.date.accessioned 2019-06-15T14:39:20Z
dc.date.available 2019-06-15T14:39:20Z
dc.date.issued 2018
dc.identifier.citation DNA loop organization in glioblastoma T98G cells at their different functional states / K.S. Afanasieva, A.Y. Semenova, L.L. Lukash, A.V. Sivolob // Вiopolymers and Cell. — 2018. — Т. 34, № 6. — С. 426-434. — Бібліогр.: 22 назв. — англ. uk_UA
dc.identifier.issn 0233-7657
dc.identifier.other DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00098D
dc.identifier.uri http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/154372
dc.description.abstract The loop domain organization of chromatin, which plays an important role in transcription regulation, may depend on the cell functional state. Aim. To investigate DNA loop reorganization upon functional transitions in the glioblastoma T98G cells. Methods. Single cell gel electrophoresis (a comet assay) was used to analyze the kinetics of the DNA loop migration from the nucleoids obtained from the lysed cells. Results. The cells arrested in the G1 phase of the cell cycle were characterized by a relatively low amount of DNA in the comet tails due to a low content of DNA in the loops which may be resolved by the comet assay (up to ~300 kb). After cell reactivation, the contour length of the loops essentially increased in parallel with a decrease in the linear loop density along the genome. Conclusions. An increase in the loop size and a respective decrease in the loop density may be a general feature of activated cells as we earlier observed similar effects upon activation of human lymphocytes. uk_UA
dc.description.abstract Організація петельних доменів хроматину, яка відіграє важливу роль у регуляції транскрипції, напевно може залежати від функціонального стану клітини. Мета. Дослідити можливу реорганізацію петель ДНК при функціональних переходах у гліобластомних клітинах T98G. Методи. Ми застосовували метод електрофорезу ДНК ізольованих клітин (кометний електрофорез) для аналізу кінетики міграції петель ДНК з нуклеоїдів, отриманих з лізованих клітин. Результати. Клітини, заарештовані на фазі G1 клітинного циклу, характеризуються порівняно низьким вмістом ДНК у хвостах комет внаслідок низького вмісту ДНК у складі петель, що знаходяться у межах роздільної здатності кометного електрофорезу (до ~300 кб). Після реактивації клітин контурна довжина петель суттєво зростає, паралельно зі зниженням лінійної щільності петель уздовж геному. Висновки. Оскільки подібні ефекти спостерігались нами раніше для активованих лімфоцитів, ми робимо висновок, що зростання розміру петель та відповідне зниження їхньої лінійної щільності може бути загальною характеристикою активованих клітин. uk_UA
dc.description.abstract Организация петельных доменов хроматина, играющая важную роль в регуляции транскрипции, предположительно может зависеть от функционального состояния клетки. Цель. Исследовать возможной реорганизации петель ДНК при функциональных переходах в глиобластомных клетках T98G. Методы. Мы использовали электрофорез ДНК изолированных клеток (кометный электрофорез) для анализа кинетики миграции петель ДНК из нуклеоидов, полученных из лизированных клеток. Результаты. Клетки, арестованные на фазе G1 клеточного цикла, характеризуются сравнительно низким содержанием ДНК в хвостах комет из-за низкого содержания ДНК в составе петель, которые находятся в пределах разрешающей способности кометного электрофореза (до ~300 кб). После реактивации клеток контурная длина петель существенно возрастает, параллельно со снижением линейной плотности петель вдоль генома. Выводы. Поскольку аналогичные эффекты наблюдались нами ранее для активированных лимфоцитов, мы заключили, что возрастание размера петель и соответствующее снижение их линейной плотности может быть общей характеристикой активированных клеток. uk_UA
dc.language.iso en uk_UA
dc.publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України uk_UA
dc.relation.ispartof Вiopolymers and Cell
dc.subject Structure and Function of Biopolymers uk_UA
dc.title DNA loop organization in glioblastoma T98G cells at their different functional states uk_UA
dc.title.alternative Організація петельних доменів ДНК в гліобластомних клітинах T98G за їх різних функціональних станів uk_UA
dc.title.alternative Организация петельных доменов ДНК в глиобластомных клетках T98G при их разных функциональных состояниях uk_UA
dc.type Article uk_UA
dc.status published earlier uk_UA
dc.identifier.udc 577.323:576.08


Файли у цій статті

Ця стаття з'являється у наступних колекціях

Показати простий запис статті

Пошук


Розширений пошук

Перегляд

Мій обліковий запис