Построение филогенетического древа растительных тубулинов на основании гомологии их белковых последовательностей

Abstract

Построено филогенетическое древо α-, β- и γ-тубулинов растительного царства, α- и β-тубулинов свиньи, а также всех ε- и δ-тубулинов с известными первичными последовательностями и произведен анализ уровней гомологии тубулиновых последовательностей для представителей разных групп организмов. Выявлены низкая гетерогенность α- и γ-тубулиновых семейств и более чем в два раза большая гетерогенность β-тубулинов, обусловленная особенностями последовательностей тубулинов из водорослей. Продемонстрировано, что последовательности тубулинов из животных не входят ни в один кластер, образованный растительными тубулинами. Также показано наличие в первичных последовательностях тубулинов трех основных семейств небольших специфических отличий, являющихся характерными для таких филогенетических единиц растительного царства, как водоросли и классы покрытосеменных. Кладограмма иллюстрирует четкую кластеризацию исследуемых последовательностей по их принадлежности к тубулиновым семействам.

We have built phylogenetic tree of α-, β- and γ-tubulins of plant kingdom, α-and β- tubulins of pig, and all ε- and δ- tubulins with known primary sequences and analyzed the rates of homology of tubulin sequences for repersentatives of different groups of organisms. It has been detected low heterogeneity of α-, γ - tubulin families and more than two fold higher heterogeneity of β- tubulins, based on the sequence speciality of alga tubulins. We have showed that sequences of animal tubulins do not fit any cluster based on the plant tubulins. Presence in primary tubulin sequences of three major families of insignificant specific differences which are specific for such phylogenetic items of plant kingdom as alga and angiosperms has been also demostrated. The cladogramm shows clear clasterization of investigated sequences according to their belonging to the tubulin families.