http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95580 Thu, 09 Apr 2026 00:36:15 GMT 2026-04-09T00:36:15Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/bitstream/id/284682/ http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95580 http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95848 Дослiдження взаємодiї "корових” 2′,5′-олiгоаденiлатiв iз деякими протеїнами методом флуоресцентної спектроскопiї Ткачук, В.В.; Левченко, С.М.; Ребрiєв, А.В.; Ткачук, Л.В.; Черних, С.I.; Ткачук, З.Ю. Вивчали взаємодiю “корового” олiгоаденiлату (2′,5′-A₃) та його аналогiв iз альбумiном, iнтерфероном, iнсулiном, iмуноглобулiном та кальмодулiном методом флуоресцентної спектроскопiї та мас-спектрометрiї. Показано, що всi дослiджуванi олiгоаденiлати гасять власну флуоресценцiю цих бiлкiв рiзною мiрою i це гасiння має концентрацiйну залежнiсть. 2′,5′-А₃ та його аналоги 2′,5′-А₃-thio, 2′,5′-A₃-ino i 2′,5′-A₃-cord iстотно гасять флуоресценцiю протеїнiв при збудженнi молекул довжиною хвилi 280 нм i значно менше при збудженнi 296 нм, що може свiдчити про можливу роль тирозину в процесах зв’язування цих препаратiв з бiлками. Разом з тим у випадку 2′,5′-А₃-epo i 2′,5′-А₃-NH₂ їх взаємодiя з бiлками може вiдбуватися за участю тирозину i триптофану, оскiльки спостерiгається значне збiльшення гасiння флуоресценцiї бiлкiв при довжинi хвилi збудження 296 нм, особливо для 2′,5′-А₃-NH₂. Обговорюються можливi механiзми взаємодiї олiгоаденiлатiв з дослiджуваними бiлками.; Изучали взаимодействие “корового” олигоаденилата (2′,5′-A₃) и его аналогов с альбумином, интерфероном, инсулином, иммуноглобулином и кальмодулином методом флуоресцентной спектроскопии и масс-спектрометрии. Показано, что все исследуемые олигоаденилаты тушат собственную флуоресценцию этих белков в разной степени и это тушение имеет концентрационную зависимость. 2′,5′-А₃ и его аналоги 2′,5′-А₃-thio, 2′,5′-A₃-ino i 2′,5′-A₃-cord существенно тушат флуоресценцию протеинов при возбуждении молекул длиной волны 280 нм и значительно меньше при возбуждении 296 нм, что может свидетельствовать о возможной роли тирозина в процессах связывания этих препаратов с белками. В то же время в случае 2′,5′-А₃-epo и 2′,5′-A₃-NH₂ их взаимодействие с белками может происходить с участием тирозина и триптофана, поскольку наблюдается значительное увеличение тушения флуоресценции белков при длине волны возбуждения 296 нм, особенно для 2′,5′-А₃-NH₂. Обсуждаются возможные механизмы взаимодействия олигоаденилатов с исследуемыми белками.; The interactions between “core” oligoadenylates (2′,5′-A₃) and its analogs with albumin, interferon, insulin, immunoglobulin, and calmodulin are studied, by using fluorescence spectroscopy and mass spectrometry. It is shown that all oligoadenylates quench the intrinsic fluorescence of these proteins in varying degrees. Quenching degree depends on the olygoadenylates concentration. 2′,5′-A₃ and its analogs 2′,5′-A₃-thio, 2′,5′-A₃-ino, and 2′,5′-A₃-cord substantially quench the proteins fluorescence excited at a wavelength of 280 nm and do significantly less at an excitation wavelength of 296 nm that may indicate the possible tyrosine role in the binding of these drugs to proteins. At the same time, in the case of 2′,5′-A₃-epo and 2′,5′-A₃-NH₂, their interaction with proteins can occur via tyrosine and tryptophan, as there is a significant increase in the proteins fluorescence quenching at an excitation wavelength of 296 nm, especially for 2′,5′-A₃-NH₂. Possible mechanisms of interaction between the investigated proteins and oligoadenylates are under discussion. Thu, 01 Jan 2015 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95848 2015-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95847 Сравнительный таксономический анализ Pseudomonas batumici и эволюционно близких ему видов Клочко, В.В. На основании анализа последовательностей гена 16S рРНК установлено, что штамм Pseudomonas batumici УКМ В-321 образует отдельную ветвь внутри рода Pseudomonas с эволюционно наиболее близкими ему видами P. gingeri и P. baetica — 98% сходства последовательностей гена 16S рРНК. Отличия между названными видами, определенные путем полифазного таксономического анализа, состоят в наличии некоторых ферментов, способности к пигментообразованию, спектрах потребляемых источников углерода, содержании жирных кислот, антагонистической активности. Синтез антистафилококкового антибиотика батумина обнаружен только у P. batumici и, по-видимому, является уникальной особенностью штаммов этого вида.; На основi аналiзу послiдовностей гена 16S рРНК встановлено, що штам Pseudomonas batumici УКМ В-321 утворює окрему гiлку всерединi роду Pseudomonas з еволюцiйно близькими до нього видами P. gingeri i P. baetica — 98% подiбностi послiдовностей гена 16S рРНК. Вiдмiнностi мiж наведеними видами, встановленi полiфазним таксономiчним аналiзом, полягають в наявностi ряду ферментiв, здатностi до пiгментоутворення, спектрах вуглецевого живлення, вмiсту жирних кислот, антагонiстичнiй активностi. Синтез антистафiлококового антибiотика батумiну виявлений тiльки у P. batumici i, вiрогiдно, є унiкальною особливiстю штамiв цього виду.; Results of 16S rRNA gene sequences analysis have been shown that strain Pseudomonas batumici UCM В-321^T forms a separate branch within the genus Pseudomonas and has 98% of 16S rRNA gene sequence similarity with evolutionally most related species P. gingeri and P. baetica. The differences between the mentioned species determined by the polyphasic taxonomic analysis include the presence of some enzymes, pigments production, spectra of assimilated carbon sources, fatty acid profiles, and antagonistic activity. Synthesis of antistaphylococcal antibiotic batumin was found only in P. batumici strains and is, probably, the unique peculiarity of this species. Thu, 01 Jan 2015 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95847 2015-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95846 Множинність бактеріоцинів, одержаних з природних ізолятів пектолітичних фітопатогенних бактерій Рectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, виділених у різних областях України Максименко, Л.О.; Войчук, С.І. Iзоляти фiтопатогенних бактерiй Рectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Б1, Б3, Б4, Б11, Б12, Б13, Б15, Б16, Б17, Б23, Б26, видiленi з бульб картоплi, вирощеної в рiзних регiонах України, з симптомами м’якої гнилi, здатнi продукувати велику кiлькiсть високомолекулярних бактерiоцинiв (MCTV). Дослiджена їх кiлерна активнiсть вiдносно лабораторних штамiв P. carotovorum i Esherichia coli. Одержанi очищенi фракцiї MCTV. Електронно-мiкроскопiчнi дослiдження показали, що вони мають вигляд хвостових вiдросткiв бактерiофагiв рiзної довжини, а також сферичних часток рiзного дiаметра. Виявленi серологiчно спорiдненi бiлки у складi MCTV iзолятiв природних штамiв P. carotovorum та бактерiофага ZF-40 за допомогою антисироваток, одержаних до MCTV колекцiйного штаму P. carotovorum J2 NCPPB 1744 та бактерiофага ZF-40. Цей факт може також свiдчити про фагову природу видiлених кiлерних часток.; Изоляты фитопатогенных бактерий Рectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Б1, Б3, Б4, Б11, Б12, Б13, Б15, Б16, Б17, Б23, Б26, выделенные из клубней картофеля, выращенного в разных регионах Украины, с симптомами мягкой гнили, способны продуцировать множество высокомолекулярных бактериоцинов (MCTV). Исследована их киллерная активность относительно лабораторных штамов P. carotovorum и Esherichia coli. Получены очищенные фракции MCTV. Электронно-микроскопические исследования показали, что они имеют вид хвостовых отростков бактериофагов разной длины, а также сферических частиц разного диаметра. Выявлены серологически родственные белки в составе MCTV изолятов природных штамов P. carotovorum и бактериофага ZF-40 с помощью антисывороток, полученных к MCTV коллекционного штама P. carotovorum J2 NCPPB 1744 и бактериофага ZF-40. Этот факт может также свидетельствовать о фаговой природе выделенных киллерных частиц.; Phytopathogenic bacteria Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum strains B1, B3, B4, B11, B12, B15, B16, B17, B23, B26 isolated from potato tubers grown in various regions of Ukraine with symptoms of soft rot disease are able to produce a variety of macromolecular bacteriocins (MCTV). Their killing activity against laboratory strains of P. carotovorum and Escherichia coli is studied. Pure fractions of MCTV are obtained. Electron microscopic analysis showed them to have shape of bacteriophage tails of various lengths, as well as phage capsids of various diameters. Serologically related proteins within MCTV of natural P. carotovorum strains and bacteriophage ZF-40 are detected, by using antiserum against MCTV of collection strain P. carotovorum J2 NCPPB 1744 and bacteriophage ZF-40. This fact can also be indicative of the phage nature of obtained killing particles. Thu, 01 Jan 2015 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95846 2015-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95845 Функціоналізація вуглецевих нанотрубок за допомогою молекул біологічного походження різної природи Бурлака, О.М.; Пірко, Я.В.; Смертенко, П.С.; Коломис, О.Ф.; Глазунова, В.О.; Константинова, Т.Є.; Ємець, А.І.; Блюм, Я.Б. З метою розширення можливостей застосування вуглецевих нанотрубок (ВНТ) у бiотехнологiї дослiджено здатнiсть молекул бiологiчного походження взаємодiяти iз ВНТ. Показано формування стабiльних водних полiдисперсних колоїдних систем одношарових та багатошарових ВНТ, нековалентно функцiоналiзованих за допомогою ряду бiомолекул — дволанцюгової ДНК, дезоксирибонуклеозидтрифосфатiв, аденозинтрифоcфату натрiю, бичачого сироваткового альбумiну, бiлкiв екстракту склистого тiла, гумату натрiю. Наведено результати раманiвської спектроскопiї, трансмiсiйної електронної та атомно-силової мiкроскопiй зразкiв функцiоналiзованих ВНТ, що свiдчать про ряд морфологiчних та структурних змiн, спричинених функцiоналiзацiєю. Обговорюються механiзми нековалентної взаємодiї бiомолекул з ВНТ.; Для расширения возможностей применения углеродных нанотрубок (УНТ) в биотехнологии исследована способность молекул биологического происхождения взаимодействовать с УНТ. Показано формирование стабильных водных полидисперсных коллоидных систем однослойных и многослойных УНТ, нековалентно функционализированных с помощью ряда биомолекул — двухцепочной ДНК, дезоксирибонуклеозидтрифосфатов, аденозинтрифоcфата натрия, бычьего сывороточного альбумина, белков экстракта стекловидного тела, гумата натрия. Приведены результаты рамановской спектроскопии, трансмиссионной электронной и атомно-силовой микроскопий функционализированных УНТ, которые свидетельствуют о ряде морфологических и структурных изменений, вызванных функционализацией. Обсуждаются механизмы нековалентного взаимодействия биомолекул с УНТ.; In order to expand biotechnological applications of carbon nanotubes (CNTs), the ability of biological molecules to interact with CNTs is studied. We report the formation of stable aqueous polydisperse colloidal systems of SWNTs and MWNTs non-covalently functionalized with several biomolecules — double-stranded DNA, deoxyribonucleotide triphosphates, adenosine triphosphate sodium salt, bovine serum albumin, vitreous body extract proteins and sodium humate. The results of Raman spectroscopy, transmission electron and atomic-force microscopies of functionalized CNTs demonstrating morphological and structural changes in CNTs caused by the functionalization are shown. Mechanisms of non-covalent biomolecules-CNTs interactions are discussed. Thu, 01 Jan 2015 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/95845 2015-01-01T00:00:00Z