http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151211 Thu, 23 Apr 2026 13:55:36 GMT 2026-04-23T13:55:36Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/bitstream/id/449874/ http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151211 http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156404 IFN-l-3 (IL28B) genotyping by restriction fragment length polymorphism method: detection polymorphism of rs12979860 Pampukha, V.M.; Kravchenko, S.A.; Moroz, L.V.; Livshits, L.A. Aim. The goal of our study was to develop an accurate detection of the SNP rs12979860 by RFLP-based method and to evaluate the polymorphic genotype distribution forthis SNP among individuals with unknown HCV status from Ukraine. Methods.The SNP rs12979860 was tested by PCR RFLP-based method in 99 individuals from Ukraine. Results. The method of accurate detection of the SNP rs12979860 was developed. The genotypes distributions were: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Conclusions. Due to the high incidence of CC genotype, found in ourstudy, the SNP rs12979860 analysis may be useful for Ukrainian patientsto predict responsesto the treatment considering the HCV genotype and viral load. Keywords: IFN-l-3 (IL28B) gene, SNP rs12979860, PCR-RFLP method, hepatitis C.; Мета. Метою даної роботи була розробка простого методу детекції поліморфізму rs12979860 на основі ПДРФ-аналізу та проведення генотипування за даним поліморфізмом серед індивідів з невизначеним статусом хронічного гепатиту С в популяції України. Методи. SNP rs12979860 проаналізовано методом ПЛР/ ПДРФ серед 99 індивідів з України. Результати. Розроблено точний метод детекції rs12979860 та виявлено такий розподіл генотипів: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Висновки. Зважаючи на визначену високу частоту генотипу СС у нашому дослідженні, аналіз поліморфізму rs12979860 можна застосовувати в Україні для прогнозу відповіді пацієнта на лікування з урахуванням генотипу вірусу С і вірусного навантаження. Ключові слова: ген IFN-l-3 (IL28B4), SNP rs12979860, метод ПЛР/ПДРФ, гепатит C.; Цель. Цель данной работы состояла в разработке простого метода определения полиморфизма rs12979860 на основе ПДРФанализа и проведение генотипирования по данному полиморфизму среди индивидов с неустановленным статусом хронического гепатита С из Украины. Методы. SNPrs12979860 проанализирован методом ПЦР/ПДРФ среди 99 индивидов из Украины. Результаты. Разработан точный метод детекции rs12979860 и выявлено следующее распределение генотипов в популяции Украины: CC – 56 %, CT – 34 %, TT – 10 %. Выводы. Принимая во внима - ние высокую частоту генотипа СС, определенную в нашем исследовании, можно сделать вывод о том, что анализ полиморфизма rs12979860 целесообразно применять в Украине для прогноза ответа пациента на лечение с учетом генотипа вируса С и вирусной нагрузки. Ключевые слова: ген IFN-l-3 (IL28B4), SNP rs12979860, метод ПЦР/ПДРФ, гепатит C. Sat, 01 Jan 2011 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156404 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156403 Дослідження можливої ролі поліморфізму генів системи детоксикації та коагуляції крові у патогенезі втрати вагітності Татарський, П.Ф.; Кучеренко, А.М.; Хажиленко, К.Г.; Зінченко, В.М.; Ільїн, І.Є.; Лівшиць, Л.А. Мета. Дослідити асоціацію поліморфних варіантів генів ферментів першої CYP1A1 (T6235C) та другої GSTM1 («0»), GSTT1 («0») і GSTP1 (A313G) фаз системи детоксикації, а також поліморфних варіантів генів білків системи коагуляції крові F2 (G20210A), F5 (G1691A) і системи обміну фолатів MTHFR (C677T) з патогенезом, що обумовлює втрату вагітності. Методи. Поліморфні варіанти вивчали за допомогою ПЛР та ПДРФ-аналізу у 86 здорових індивідів та 109 пацієнток з втратою вагітності. Результати. «Несприятливі» поліморфні варіанти генів GSTP1 (313G) і CYP1A1 (6235C) частіше спостерігали серед пацієнток з втратою вагітності порівняно з контрольною групою. Висновки. Передбачається, що поліморфний варіант 313G гена GSTP1 може бути фактором спадкової схильності до втрати вагітності. Ключові слова: втрата вагітності, система детоксикації, система коагуляції крові, поліморфізм ДНК.; Aim. To study association of polymorphisms of the genes of the first CYP1A1 (T6235C) and second GSTM1 («0»), GSTT1 («0»), GSTP1 (A313G) phases of detoxication system as well as polymorphic variants of the genes of proteins of coagulation system F2 (G20210A), F5 (G1691A), and folate metabolism system MTHFR (C677T) with pathogenesis of pregnancy loss. Methods. Polymorphic variants were analyzed using PCR followed by RFLP analysis in 86 healthy individuals and in 109 patients with different types of pregnancy loss. Results. Unfavorable polymorphic variants GSTP1 (313G) and CYP1A1 (6235C) were observed more frequently in the patients with pregnancy loss comparing to the control group. Conclusions. We assume that the 313G polymorphic variant of GSTP1 gene may be considered as a factor of hereditary susceptibility to pregnancy loss. Keywords: pregnancy loss, detoxication system, blood coagulation system, DNA polymorphism,; Цель. Исследовать ассоциацию полиморфных вариантов генов первой CYP1A1 (T6235C) и второй GSTM1 («0»), GSTT1 («0») и GSTP1 (A313G) фаз системы детоксикации, а также полиморфных вариантов генов белков системы коагуляции крови F2 (G20210A), F5 (G1691A) и системы обмена фолатов MTHFR (C677T) с патогенезом, обусловливающим потерю беременности. Методы. Полиморфные варианты изучали с помощью ПЦР и ПДРФ анализа у 86 здоровых индивидов и 109 пациенток с потерей беременности. Результаты. «Неблагополучные» полиморфные варианты генов GSTP1 (313G) и CYP1A1 (6235C) чаще наблюдались среди пациенток с потерей беременности по сравнению с контрольной группой. Выводы. Предполагается, что полиморфный вариант 313G гена GSTP1 может быть фактором наследственной предрасположенности к потере беременности. Ключевые слова: потеря беременности, система детоксикации, система коагуляции крови, полиморфизм ДНК. Sat, 01 Jan 2011 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156403 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156399 Up-dating the Cholodny method using PET films to sample microbial communities in soil Moshynets, O.V.; Koza, A.; Dello Sterpaio, P.; Kordium, V.A.; Spiers, A.J. The aim of this work was to investigate the use of PET (polyethylene terephtalate) films as a modern development of Cholodny’s glass slides, to enable microscopy and molecular-based analysis of soil communities where spatial detail at the scale of microbial habitatsis essential to understand microbial associations and interactions in this complex environment. Methods. Classical microbiological methods; attachment assay; surface tension measurements; moleculartechniques: DNA extraction, PCR; confocal laserscanning microscopy (CLSM); micro-focus X-ray computed tomography (µCT). Results. We first show, using the model soil and rhizosphere bacteria Pseudomonas fluorescens SBW25 and P. putida KT2440, that bacteria are able to attach and detach from PET films, and that pre-conditioning with a filtered soil suspension improved the levels of attachment. Bacteria attached to the films were viable and could develop substantial biofilms. PET films buried in soil were rapidly colonised by microorganisms which could be investigated by CLSM and recovered onto agar plates. Secondly, we demonstrate that µCT can be used to non-destructively visualise soil aggregate contact points and pore spaces across the surface of PET films buried in soil. Conclusions. PET films are a successful development of Cholodny’s glass slides and can be used to sample soil communities in which bacterial adherence, growth, biofilm and community development can be investigated. The use of these films with µCT imaging in soil will enable a better understanding of soil micro-habitats and the spatially-explicit nature of microbial interactions in this complex environment. Keywords: Pseudomonas, soil, buried slide, PET film.; Мета цієї роботи полягала у дослідженні можливості використання плівок, виготовлених із ПЕТ (поліетилентетрафталат), як модифікації методу скелець обростання Холодного для мікроскопічного і молекулярно-генетичного аналізу ґрунтових спільнот із збереженням їхньої просторової архітектури на мікрорівні. Таке збереження деталей просторового розташування об’єктів дозволило б глибше вивчити їх у подібних складних середовищах проживання. Методи. Класичні мікробіологічні методи; аналіз прикріплення; вимірювання поверхневого натягнення; молекулярно-генетичні методи: екстракція ДНК, ПЛР; конфокальна лазерна скануюча мікроскопія (КЛСМ); мікрофокусна рентгенівська комп’ютерна томографія (мікроКТ). Результати. По-перше, використовуючи модельні ґрунтові і ризосферні бактерії Pseudomonas fluorescens SBW25 і P. putida KT2440, ми показали, що бактерії здатні до прикріплення і відкріплення від ПЕТ плівок, а прекультивація за умов відфільтрованої ґрунтової суспензії покращує рівень прикріплення. Бактерії, які прикріпилися до плівок, зберігають свою життєздатність і спроможні до формування повноцінної біоплівки. ПЕТ плівки, занурені в ґрунт, колонізуються мікроорганізмами, що спостерігали як за допомогою КЛСМ, так і методом культивування ПЕТ плівок, видалених з ґрунту, на агаризованому поживному середовищі. По-друге, ми продемонстрували, що мікроКТ можна використовувати для неруйнівного спостереження сайтів зв’язування ґрунтових агрегатів і ґрунтових пор з поверхнею плівки, що перебуває в ґрунті. Висновки. Застосування ПЕТ плівок виявилося вдалою модифікацією методу скелець обростання Холодного та може бути корисним для відбору ґрунтових мікробних спільнот, дослідження бактерійного прикріплення, росту і розвитку як біоплівок, так і спільноти. Використання цих плівок при аналізі ґрунтів за допомогою мікроКТ дозволить краще визначити ґрунтові мікроеконіші і природу архітектури мікробних взаємодій за таких складних екологічних умов. Ключові слова: Pseudomonas, ґрунт, скельця обростання, ПЕТ плівки.; Цель данной работы состояла в исследовании возможности использования плeнок, изготовленных из ПЭТ (полиэтилентерефталат), как современной модификации метода стeкол обрастаний Холодного для микроскопического и молекулярно-генетического анализа почвенных сообществ с сохранением их пространственной архитектуры на микроуровне. Такая сохранность деталей пространственного расположения объектов позволила бы глубже изучить их в подобных сложных условиях обитания. Методы. Классические микробиологические методы; анализ прикрепления; измерение поверхностного натяжения; молекулярногенетические методы: экстракция ДНК, ПЦР; конфокальная лазерная сканирующая микроскопия (КЛСМ); микрофокусная рентгеновская компьютерная томография (микроКТ). Результаты. Во-первых, используя модельные почвенные и ризосферные бактерии Pseudomonas fluorescens SBW25 и P. putida KT2440, мы показали, что бактерии способны к прикреплению и откреплению от ПЭТ плeнок, а прекультивирование в условиях отфильтрованной почвенной суспензии улучшает уровень прикрепления. Бактерии, прикреплeнные к плeнкам, сохраняют жизнеспособность и могут формировать полноценную биоплeнку. ПЕТ плeнки, погружeнные в почву, колонизируются микроорганизмами, что наблюдали как с применением КЛСМ, так и методом культивирования извлечe нных из почвы плeнок на агаризованной питательной среде. Во-вторых, мы продемонстрировали, что микроКТ можно использоватьа для недеструктивного наблюдения за сайтами связывания почвенных агрегатов и почвенных пор с поверхностью ПЕТ плeнки, находящейся в почве. Выводы. Применение ПЕТ плeнок оказалось удачной модификацией метода стeкол обрастаний Холодного и может стать полезным для отбора почвенных микробных сообществ, изучения бактериального прикрепления, роста, развития как биоплeнок, так и сообщества. Использование этих плeнок при анализе почвы с помощью микроКТ позволит лучше определять почвенные микроэкониши и природу архитектуры микробных взаимодействий в таких сложных экологических условиях. Ключевые слова: Pseudomonas, почва, стeкла обрастания, ПЭТ плeнки. Sat, 01 Jan 2011 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156399 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156381 Baculovirus vectors in experimental geneand vaccine therapy Solomko, A.P.; Zaharuk, O.A.; Chaschina, L.I.; Strokovskaya, L.I. The article provides a brief overview of the literature on target design, exploration properties and effectiveness of the application of recombinant baculoviruses in model systems in vivo. The results of experiments with wild and recombinant baculoviruses are analysed in regard to the priority areas of biomedicine such as tissue regeneration, gene therapy of cancer, development of vaccines against infe tious diseases and malignancies. Keywords: baculovirus, gene- and immunovector, mammals, system in vivo.; Представлен краткий обзор данных литературы по целевому конструированию и исследованию свойств и эффективности применения в модельных системах in vivo рекомбинантных бакуловирусов. Проанализированы результаты экспериментов с использованием диких и рекомбинантных бакуловирусов в таких приоритетных областях биомедицины, как регенерация тканей, генотерапия рака, разработка вакцин против инфекционных заболеваний и злокачественных новообразований. Ключевые слова: бакуловирус, гено- и иммуновектор, млекопитающие, система in vivo.; Представлено короткий огляд даних літератури стосовно цільового конструювання і дослідження властивостей та ефективності використано в модельних системах in vivo рекомбінантних бакуловірусів. Проаналізовано результати дослідів із застосуванням диких і рекомбінантних бакуловірусів у таких пріоритетних галузях сучасної біомедицини, як регенерація тканин, генотерапія раку, розробка вакцин проти інфекційних захворювань та злоякісних новоутворень. Ключові слова: бакуловірус, гено- та імуновектор, ссавці, система in vivo. Sat, 01 Jan 2011 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156381 2011-01-01T00:00:00Z