http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151134 Sun, 12 Apr 2026 05:05:01 GMT 2026-04-12T05:05:01Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/bitstream/id/449732/ http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151134 http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157523 Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с ДНК Ермак, Е.Л.; Круглова, Е.Б.; Пальчиковская, Л.И.; Алексеева, И.В. Для выяснения механизмов связывания цитидина и его биологически активных производных с ДНК исследовано их взаимодействие с ДНК в присутствии интеркалятора бромистого этидия (ЭБ). Проведен спектрофотометрический анализ электронных спектров поглощения смесей ЭБ–ДНК в присутствии цитидина и его аналогов в широкой области длин волн и концентраций ДНК. Аналоги цитидина, содержащие дополнительный атом азота в гетероцикле (6AZC, AZAfur и AZAxyl), конкурируют с ЭБ за места связывания на ДНК. Константы ассоциации и параметры мест связывания образующихся комплексов для этих производных рассчитаны с помощью программ оптимизации спектров поглощения смесей ЭБ–ДНК–нуклеозид COMP и DALSMOD. Немодифицированные по цитозиновому кольцу нуклеозиды (цитидин и Ara-C) не являются конкурентами ЭБ за места связывания на ДНК, однако в их присутствии изменяются концентрационные зависимости кривых титрования ЭБ в области низких концентраций ДНК. Это можно объяснить влиянием упомянутых нуклеозидов на структурные или конформационные изменения матрицы ДНК в присутствии ЭБ в области низких значений P/DЭБ, где P/DЭБ – отношение общих концентраций ДНК и ЭБ.; Для з’ясування механізмів зв’язування цитидину і його біологічно активних похідних з ДНК досліджено їхню взаємодію з ДНК у присутності інтеркалятора бромистого етидію (ЕБ). Здійснено детальний спектрофотометричний аналіз електронних спектрів поглинання сумішей ЕБ–ДНК за присутності цитидину і його аналогів у широкій області довжин хвиль і концентрацій ДНК. Аналоги цитидину, що містять додатковий атом азоту у гетероциклі (6AZC, AZAfur та AZAxyl), конкурують з ЕБ за місця зв’язування на ДНК. Константи асоціації і величини місць зв’язування утворюваних комплексів для цих похідних розраховано нами за допомогою програм оптимізації спектрів поглинання сумішей ЕБ–ДНК–нуклеозид COMP та DALSMOD. Немодифіковані по цитозиновому кільцю нуклеозиди (цитидин та Ara-C) не є конкурентами ЕБ за місця зв’язування на ДНК, але у їхній присутності змінюється характер концентраційних залежностей кривих титрування в області низьких концентрацій ДНК. Це можна пояснити впливом зазначених нуклеозидів на структурні та конформаційні зміни матриці ДНК за присутності ЕБ в області низьких значень P/DЕБ, де P/DEБ – відношення загальних концентрацій ДНК та EБ.; To study the mechanisms of cytidine and its biologically active analogues binding to DNA we analyzed the binding of these ligands to the DNA in the presence of well-known intercalator ethidium bromide (EtBr). Thereto, we carried out the detailed spectrophotometric research of EtBr-DNA mixtures absorption in the presence of cytidine and its analogues in the wide range of wavelengths and DNA concentrations. Cytidine derivatives containing azagroup in the cytosine ring (6AZC, AZAfur, and AZAxyl) compete with EtBr for the DNA binding sites. The binding constants and binding site sizes of the ligand-DNA complexes were calculated via absorption spectra optimization programs COMP and DALSMOD. Unmodified in cytosine ring ligands (cytidine and Ara-C) do not compete with EtBr for the DNA binding sites, however they contribute to the change of concentration dependencies of titration curves in the region of low DNA concentrations. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157523 2007-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157522 Дослідження інфрачервоного спектра молекули Fe(II)-порфіну в різних спінових станах квантово-хімічним методом функціоналу густини Мінаєв, Б.П.; Мінаєв, О.Б.; Говорун, Д.М. Квантово-хімічним методом теорії функціоналу густини розраховано інфрачервоний (ІЧ) спектр поглинання молекули Fe(ІІ)-порфіну для синглетного, триплетного та квінтетного спінових станів. Для оптимізації геометрії і розрахунку ІЧ спектра молекули використано необмежений за спіном функціонал UB3LYP у базисі 6-311G. Показано, що квінтетний стан 5В2g симетрії D₂h є основним. Для триплетного стану з низькою енергією ³A₂g і синглетного стану з високою енергією ¹A₁g , які мають симетрію D₄h, ІЧ спектри досліджено в точковій групі симетрії D₂h. Проаналізовано усі активні в ІЧ спектрі коливальні моди. У квінтетному стані низькочастотні неплощинні коливальні моди з великим зміщенням іона Fe(ІІ) мають різні інтенсивності і частотні зміщення порівняно з синглетним і триплетним станами.; The infrared (IR) absorption spectra of the Fe(II) porphin molecule (Fe(II)P) are calculated by the quantum-chemical method of density functional theory (DFT) for the singlet, triplet, and quintet spin states. The UB3LYP functional with the 6-311G basis set is used in geometry optimization and IR calculations. The quintet state ⁵B₂g of the D₂h symmetry is found to be the ground state. Though the close-lying triplet ³A₂g and high-energy singlet ¹A₁g states belong to the D₄h symmetry, the IR spectra have been analyzed in terms of the lower symmetry D₂h point group. All IR active vibrations are tabulated and discussed. The low-frequency modes with large out-of-plane displacements of Fe(II) ion have different IR intensities, normal vibrations, and frequency shifts in the quintet state in respect to the singlet and triplet states.; Квантово-химическим методом теории функционала плотности рассчитаны инфракрасные (ИК) спектры поглощения молекулы Fe(II)-порфина для синглетного, триплетного и квинтетного спиновых состояний. Для оптимизации геометрии и расчета ИК спектра использован неограниченный по спину функционал UB3LYP в базисе 6-311G. Показано, что квинтетное состояние ⁵B₂g симметрии D₂h является основным. Для триплетного состояния с низкой энергией ³A₂g и синглетного состояния с высокой энергией ¹A₁g, имеющих симметрию D₄h, ИК спектры изучены в точечной группе симметрии D₂h. Проанализированы все активные в ИК спектре колебательные моды. В квинтетном состоянии низкочастотные внеплоскостные колебательные моды с большим смещением иона Fe(II) имеют различные интенсивности и частотные сдвиги по сравнению с синглетным и триплетным состояниями. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157522 2007-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157521 Conductometric biosensor based on whole-cell microalgae for assessment of heavy metals in wastewater Berezhetskyy, A.L.; Durrieu, C.; Nguyen-Ngoc, H.; Chovelon, J.-M.; Dzyadevych, S.V.; Tran-Minh, C. Whole-cell Chlorella vulgaris conductometric biosensors consisting of gold planar interdigitated electrodes and sol-gel algal membranes have been used for assessment of heavy-metal ions in water. These analytes act as algal alkaline phosphatase inhibitors. Enzyme residual activity has been measured in Tris-nitrate buffer in the presence of Mg²⁺ ions as activator. Operating conditions of this biosensor have been optimized and its characteristics are discussed. Detection limits are about 1 ppb for Cd²⁺, Co²⁺, Ni²⁺, Pb²⁺ and 10 ppb for Zn²⁺. The storage stability of the biosensor in buffer solution at 4 oC is more than 40 days. The biosensor has been used to assess wastewater pollution.; Описан биосенсор для оценки содержания тяжелых металлов в воде. Для его создания клетки Chlorella vulgaris иммобилизировали на золотых планарных гребенчатых электродах с помощью золь–гель технологии. Тяжелые металлы являются ингибиторами щелочной фосфатазы. Остаточную активность иммобилизованного фермента измеряли в трис-нитратном буферном растворе в присутствии активатора: ионов магния. Оптимизированы рабочие характеристики биосенсора. Нижняя граница определения составляла 1 млрд ⁻¹ для Cd²⁺, Co²⁺, Ni²⁺, Pb²⁺ и 10 млрд ⁻¹ для Zn²⁺. Срок хранения биосенсора в буферном растворе при температуре 4 оC составляет более 40 дней. Биосенсор использован для оценки загрязнения тяжелыми металлами сточных вод.; Описано біосенсор для оцінки вмісту важких металів у воді. Для його створення клітини Chlorella vulgaris іммобілізували на золотих планарних гребінчастих електродах за допомогою золь–гель технології. Важкі метали є інгібіторами лужної фосфатази. Залишкову активність іммобілізованого ферменту вимірювали в трис-нітратному буферному розчині за присутності активатора – іонів магнію. Оптимізовано робочі характеристики біосенсора. Нижня межа визначення складала 1 млрд ⁻¹ для Cd²⁺, Co²⁺, Ni²⁺, Pb²⁺ та 10 млрд ⁻¹ для Zn²⁺. Термін зберігання біосенсора у буферному розчині за температури 4 оC був більшим, ніж 40 діб. Біосенсор використано для оцінки забруднення важкими металами стічних вод. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157521 2007-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157520 Оптимізація методики визначення сахарози в соках і солодких напоях кондуктометричним ферментним біосенсором Пєшкова, В.М.; Солдаткін, О.О.; Дзядевич, С.В. Розроблено та оптимізовано методику визначення сахарози в соках і солодких напоях кондуктометричним ферментним біосенсором. Підібрано оптимальне співвідношення та концентрацію ферментів у біоселективному елементі біосенсора для найбільшої його стабільності та чутливості. Розглянуто різні варіанти виявлення сахарози в зразках за допомогою біосенсора та проведено визначення сахарози та глюкози в соках і солодких напоях. Запропоновану методику можна надалі використовувати у харчовій промисловості для контролю і оптимізації виробництва.; The working procedure of sucrose and glucose conductometric biosensors with real samples of juices and sweet drinks has been presented. For the purpose of sensitivity and stability improvement of the sucrose biosensor, optimal enzyme proportions and concentrations in its bioselective element have been chosen. Different variants of determination of sucrose and glucose in real samples using the biosensor have been considered. The sucrose and glucose measurement has been carried out in juices and sweet drinks. The method suggested could be used in food industry for the production control and optimization.; Разработана и оптимизирована методика определения сахарозы в соках и сладких напитках с помощью кондуктометрического ферментного биосенсора. Подобраны оптимальное соотношение и концентрации ферментов в биоселективном элементе биосенсора для наибольшей его стабильности и чувствительности. Рассмотрены разные варианты выявления сахарозы в образцах с помощью биосенсора и проведено определение сахарозы и глюкозы в соках и сладких напитках. Предложенную методику можно использовать в дальнейшем в пищевой промышленности для контроля и оптимизации производства. Mon, 01 Jan 2007 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/157520 2007-01-01T00:00:00Z