http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151080 Sun, 12 Apr 2026 22:20:40 GMT 2026-04-12T22:20:40Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/bitstream/id/449598/ http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151080 http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155987 Стабілізація Вотсон-Криківських пар основ ДНК протонуванням: квантово-хімічне дослідження Потягайло, А.Л.; Говорун, Д.М. Напівемпіричним квантово-хімічним методом AMI встановлено, що одноразове проточування Вотсон-Криківських пар основ ДНК по місцях, які не беруть участі у водневому зв'язуванні, підвищує їхню стабільність. Найбільший енергетичний ефект спостерігається при протонуванні атомів O2 і O4 Thy пари Ade.Thy – він супроводжується перенесенням протона від атома N3 Thy+ до атома N1 Ade і суттєвою зміною геометричної структури пари. Найбільші геометричні збурення мають місце в парі Gua:Cyt*(O2), яка розкривається і стабілізується лише одним Н-зв'язком N4H...O6 (два інших Н-зв'язки при цьому розриваються). Вперше висловлено припущення, що проточування основ ДНК та їхніх Вотсон-Криківських пар є поліфункціональним фізико-хімічним механізмом, який може використовуватися як на етапі збереження генетичної інформації (стабілізація пар основ з метою запобігання їхньої модифікації), так і під час реплікації ДНК (підтримання ДНК-полімеразою канонічного таутомерного статусу основ, що одночасно поліпшує їхню здатність до комплементарного спарювання). Не виключається також, що проточування атома O2 Cyt пари Gua:Cyt є елементарним механізмом дії білків, від­ повідальних за розплітання ДНК; By means of semi-empirical quantum-chemical method AMI the protonation of Watson-Crick, base pairs at the positions that don't participate in H-binding has been found to stabilize these pairs. The greatest effect has been observed upon the protonation of Thy O2 and O4 atoms of the pair Ade:Thy with the proton transfer from Thy N3 to Ade N1 and significant changes in the pair geometrical structure. The maximal geometrical changes occur in the pair Gua:Cyt (O2) which opens, being stabilized by only one H-bond N4H...O6 (two other H-bonds are broken). The protonation of DNA bases and their Watson-Crick pairs is assumed to be a multifunctional physico-chemical mechanism, which is possibly used for both preservation of genetic information (DNA base pairs' stabilization to prevent their modification) and DNA replication (DNA-polymerase provides base pairs with canonical status that improves at the same time their ability for complementary pairing). Besides, the protonation of Cyt O2 atom in the pair Gua:Cyt is likely to be a common mechanism of action of proteins responsible for DNA untwisting.; Полу эмпирическим квантово-химическим методом AMI уста­новлено, что одноразовое протонирование Уотсон-Криковских пар оснований ДНК по местам, не участвующим в водородном связывании, повышает их стабильность. Наибольший эффект наблюдается при протонировании атомов O2 и O4 Thy пары Ade.Thy – он сопровождается перенесением протона от ато­ма N3 Thy+ к атому N1 Ade и существенным изменением геометрической структуры пары. Максимальные геометриче­ ские изменения имеют место для пары Gu·Cyt (O2), которая раскрывается, стабилизируясь при этом лишь одной водород­ной связью N4H...O6 (две другие Н-связи при этом разрыва­ются). Впервые высказано предположение, что протонирование оснований ДНК и их Уотсон-Криковских пар является полифункциональным физико-химическим механизмом, кото­рый может использоваться белками как на этапе хранения генетической информации (стабилизация пар оснований ДНК для предотвращения их модификации), так и во время репли­кации ДНК (поддержание ДНК-полимеразой канонического таутомерного статуса нуклеотидных оснований, одновременно улучшающее способность последних к комплементарному спариванию). Не исключается также, что протонирование ато­ма O2 Cyt пары Gua:Cyt является элементарным механизмом действия белков, ответственных за расплетание ДНК Tue, 01 Jan 2002 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155987 2002-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155986 Роль гена aleutian в онтогенезе Mustela vison. Оценка жизнеспособности щенков генотипов ррАа и рраа, полученных от скрещивания ррАа самок и рраа самцов норок Вагин, Ю.В. Установлено, что жизнеспособность щенков генотипов ррАа и рраа, полученных от спаривания серебристо-голубых самок М. vison, гетерозиготных по гену aleutian (ррАа), с сапфировыми (рраа) самцами, была одинаковой в течение раннего постнатального развития.; Виявлено, що життєздатність щенят генотипів ррАа и рраа, одержаних від спарювання сріблясто-блакитних самиць норок М. vison, гетерозиготних за геном aleutian (ррАа), із сап­ фіровими самцями, була однаковою протягом раннього по­ стнатального розвитку.; The vitality of cubs of ppAa and ppaa genotypes, obtained from the silver-blue females heterozygous by aleutian gene (ppAa) and sapphire males crosses of M. vison minks, has been established to be identical during the early postnatal development. Tue, 01 Jan 2002 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155986 2002-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155984 Among Escherichia coli Genetic Stock Center strains many are resistant to cytotoxic antimetabolites Cherepenko, E.I.; Karpenko, O.I. Mutants resistant to cytotoxic antimetabolites arise in E. coli with a frequency about 10⁻⁴. Because most in this collection strains contacted a mutagen we checked how many strains could tolerate two inhibitors used: glyphosate and 6-aza-uracil. Among 28 strains studied 12 could tolerate these inhibitors.; Враховуючи, що при мутагенному обробленні клітин кишкової палички частота виникнення мутантів стійких до цитоток­сичних антиметаболітів, складає 1·10⁻⁴ , перевірено, як часто у цих штамах відбувається зміна ознаки від чутливості до стійкості до двох інгібіторів: гліфосату та 6-аза-урацилу. З 28 вивчених штамів 12 виявилися стійкими.; Учитывая, что при мутагенной обработке клеток кишечной палочки частота возникновения мутантов, устойчивых к цитотоксическим антиметаболитам, составляет 1·10⁻⁴ , проверено, как часто в этих штаммах происходило изменение признака от чувствительности к устойчивости к двум инги­биторам: глифосату и 6-аза-урацилу. Из 28 изученных штам­мов 12 оказались устойчивыми. Tue, 01 Jan 2002 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155984 2002-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155983 Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. Мезо-заміщені триметинціанінові барвники для флуоресцентної детекци нуклеїнових кислот Лукашов, С.С.; Лосицький, М.Ю.; Ковтун, Ю.П.; Ярмолюк, С.М. Синтезовано низку нових симетричних і несиметричних триметинових ціанінів з різноманітними замісниками у мезо-положенні поліметинового ланцюга. У присутності ДНК, РНК і в меншій мірі в присутності білка інтенсивність флуоресценції барвників зростає. Максимальне зростання становить 270 разів. Найбільші його значення спостерігаються для барвників з метальною групою в мезо-положенні поліметинового ланцюга. Якщо більш масивні групи – ароматичні чи трет-алкільний залишки – з'єднані з мезо-положенням гнучким аліфатичним ланцюгом з 1—3 СНг груп, то флуоресцентні властивості таких барвників за присутності нуклеїнових кислот близькі до властивостей мезо-метил-заміщених барвників.; Синтезирован ряд новых симметричных и несимметричных триметиновых цианинов с разнообразными заместителями в мезо-положении полиметиновой цепи. В присутствии ДНК, РНК и в меньшей мере в присутствии белка интенсивность флуоресценции красителей повышается. Увеличение интенсивости достигает 270 раз. Наибольшие значения возрастания интенсивности наблюдаются для красителей с метильной группой в мезо-положении полиметиновой цепи. Если более массивная группа – ароматические или трет-алкильный ос­татки соединены с мезо-положением гибкой алифатической цепочкой из 1–3 СН2 групп – то флуоресцентные свойства таких красителей в присутствии нуклеиновых кислот близки свойствам мезо-метил-замещенных красителей.; A series of trimethinecyanines with different meso-substituents in polymethine chain has been synthesized, and spectral luminescent properties of the dyes in the presence of double-stranded DNA, RNA and bovine serum, albumin (BSA) have been examined. The dyes fluorescence enhances up to 270-fold in the presence of nucleic acids while in the presence of protein the increase is lower. The highest rise of fluorescence intensity has been observed for the dye-nucleic acid complexes of meso-methyl-substituted dyes. When large substituents like aryl- or tret-alkyl groups are linked to the mesa-position of the dyes polymethine chain by a flexible chain from 1—3 CH^-groups, the fluorescent properties of these dyes are similar to those of the meso-methyl-substituted dyes. Tue, 01 Jan 2002 00:00:00 GMT http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155983 2002-01-01T00:00:00Z