http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/70985 2026-04-06T16:35:49Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/87940 Анізотропний модель динамічної трикристальної Ляве-дифрактометрії структурної досконалости кристалічних виробів нанотехнологій. ІІ. Дифузна складова динамічної картини розсіяння Молодкін, В.Б.; Оліховський, С.Й.; Шелудченко, Б.В.; Лень, Є.Г.; Когут, М.Т. В межах узагальненої динамічної теорії розсіяння Рентґенових променів у недосконалих кристалах розглянуто динамічне дифузне розсіяння (ДР) від крупних дефектів у випадку геометрії дифракції за Ляве. Одержано аналітичні вирази для диференційної та проінтеґрованої за вертикальною розбіжністю інтенсивностей ДР у кристалі з однорідно розподіленими дефектами, які створюють навколо себе анізотропні поля зміщень атомів матриці. Для дефектів ріжних типів і розмірів побудовано карти розподілу інтенсивности ДР у просторі оберненої ґратниці й продемонстровано вплив на їх вигляд інтеґрування за вертикальною розбіжністю Рентґенових променів.; В рамках обобщённой динамической теории рассеяния рентгеновских лучей в несовершенных кристаллах рассмотрено динамическое диффузное рассеяние (ДР) от крупных дефектов в случае геометрии дифракции по Лауэ. Получены аналитические выражения для дифференциальной и проинтегрированной по вертикальной расходимости интенсивностей ДР в кристалле с однородно распределёнными дефектами, которые создают вокруг себя анизотропные поля смещений атомов матрицы. Для дефектов разных типов и размеров построены карты распределения интенсивности ДР в пространстве обратной решетки и продемонстрировано влияние на их вид интегрирования по вертикальной расходимости рентгеновских лучей.; Within the framework of the generalized dynamical theory of x-ray scattering from imperfect crystals, the dynamical diffuse scattering (DS) by large defects is considered in the case of Laue diffraction geometry. Analytical expressions for DS intensities, which are differential or integrated over the vertical divergence, are obtained for crystals containing homogenously distributed defects, which create around themselves the anisotropic displacement fields of atoms in a matrix. For defects of various types and sizes, the maps of DS intensity distributions in the reciprocal lattice space are plotted, and the influence of the integration over vertical divergence of x-rays on their shape is demonstrated. 2008-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/76191 Isolation of Nucleic Acids from Different Biological Objects with Silica—Magnetite Nanoparticles Volkova, N.N.; Derjabin, O.N.; Dudchenko, N.O. Now, modified magnetic particles are widely used in different biological and medical applications (enzyme and protein immobilization, cells separation and purification, MRI, targeted drug delivery, etc.). The aim of the present study is to reveal the ability of synthesized silica-modified magnetic particles to isolate DNA from the biological tissues in comparison with common method used the non-magnetic particles. Magnetite (Fe3O4) particles are prepared via co-precipitation of Fe+2 and Fe+3 with NH4OH in aqueous solution. Silica—magnetite nanocomposites are prepared via tetraethoxysilane hydrolyzation in alcohol—water—ammonia mixture. The average core size of synthesized magnetic nanoparticles is about 15 nm (according to the TEM data). Application of these compounds for DNA isolation from different biological objects showed significant time-savings, overall higher yields, lower RNA contamination and better polymerase chain reaction (PCR) amplification compared to commercial available silica non-magnetic particles (Promega). High efficiency of nucleic-acid purification by silica—magnetite particles is confirmed in molecular assays with reverse transcriptase—polymerase chain reaction (RT—PCR) assays of RNA- and DNA-virus diseases of plants, avian, cattle and estimation of bacterial spectrum in dairy products (probiotics).; Модифіковані магнетні частинки зараз широко використовуються для різних біологічних та медичних застосувань (іммобілізація ензимів та білків, виділення та очищення клітин, ЯМР, направлена доставка ліків та ін.). Метою цього дослідження було показати здатність синтезованих магнетних частинок, модифікованих кремнеземом, виділяти ДНК з різних біологічних тканин у порівнянні із стандартною методою з використанням немагнетних частинок. Магнетитові (Fe3O4) частинки було одержано шляхом співосадження Fe+2 та Fe+3 за допомогою NH4OH у воднім розчині. Силікамагнетитові нанокомпозити були одержані шляхом гідролізації тетраетоксисилана у спирто-водяно-амонійній суміші. Середній розмір ядра синтезованих магнетних наночастинок був біля 15 нм (за даними просвітлювальної електронної мікроскопії). Застосування цих сполук для виділення ДНК зрізних біологічних тканин виявило значне заощадження часу, загальний більш високий вихід ДНК, більш низьку кількість домішок РНК та кращу ампліфікацію полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) у порівнянні з традиційними силіційовими немагнетними частинками (Promega). Високу ефективність очищення нуклеїнових кислот за допомогою силіка-магнетитових частинок було підтверджено в молекулярно-біологічних тестах, що були виконані на основі зворотньої транскрипції з подальшою полімеразною ланцюговою реакцією (ЗТ—ПЛР) щодо виявлення РНК та ДНК вірусних захворювань рослин, птахів, сільськогосподарських тварин та оцінки якости молочних продуктів (пробіотиків).; Модифицированные магнитные частицы сейчас широко используются в различных биологических и медицинских приложениях (иммобилизация энзимов и белков, выделение и очистка клеток, ЯМР, направленная доставка лекарств и т.д.). Целью настоящего исследования было показать способность синтезированных магнитных частиц, модифицированных кремнеземом, выделять ДНК из различных биологических тканей по сравнению со стандартным методом с использованием немагнитных частиц. Магнетитовые (Fe3O4) частицы были получены путем соосаждения Fe+2 и Fe+3 с помощью NH4OH в водном растворе. Кремний-магнетитовые нанокомпозиты были приготовлены путем гидролизации тетраетоксисилана в спирто-водно-аммониевой смеси. Средний размер ядра синтезированных магнитных наночастиц был около 15 нм (по данным просвечивающей электронной микроскопии). Применение этих соединений для выделения ДНК из различных биологических тканей выявило значительную экономию времени, общий более высокий выход ДНК, более низкое количество примесей РНК и лучшую амплификацию полимеразной цепной реакции (ПЦР) по сравнению с коммерчески доступными кремниевыми немагнитными частицами (Promega). Высокая эффективность очистки нуклеиновых кислот с помощью кремний-магнетитовых частиц была подтверждена в молекулярно-биологических тестах, выполняемых на основе обратной транскрипции с последующей полимеразной цепной реакцией (ОТ—ПЦР) по выявлению РНК и ДНК вирусных заболеваний растений, птиц, сельскохозяйственных животных и оценке качества молочных продуктов (пробиотиков). 2008-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/76190 Адсорбция белков на частицах наноразмерного порошка CoFe₂O Першина, А.Г.; Сазонов, А.Э.; Итин, В.И.; Терехова, О.Г.; Магаева, А.А. Установлена адсорбционная активность наноразмерных частиц CoFe₂O₄, синтезированных методом механохимического синтеза из солевых систем, в отношении белковых молекул на примере бычьего сывороточного альбумина (БСА) и фермента Taq-полимеразы. Размер, структура и состав частиц охарактеризованы методом электронной микроскопии и рентгеноструктурного анализа. Молекулы белков иммобилизуются на поверхности частиц, стабилизированных Tween в водных буферных системах. Связывание подтверждено методом ИК-спектрометрии. Получен функциональный бионанокомпозит на основе суперпарамагнитных частиц нанопорошка CoFe₂O₄.; Встановлено адсорбційну активність нанорозмірних частинок CoFe₂O₄, синтезованих методою механохемічної синтези із сольових систем, щодо білкових молекуль на прикладі бичачого сироваткового альбуміну (БСА) і ферменту Taq-полімерази. Розмір, структуру й склад частинок охарактеризовано методою електронної мікроскопії та рентґеноструктурної аналізи. Показано, що молекулі білків іммобілізуються на поверхні частинок, стабілізованих Tween у водних буферних системах. Зв’язування підтверджено методою ІЧ-спектрометрії. Одержано функціональний біонанокомпозит на основі суперпарамагнетних частинок нанопорошку CoFe₂O₄.; Adsorption activity of nanosize CoFe₂O₄ particles with regard to albumin molecules is demonstrated for bovine serum albumin (BSA) and enzyme Taqpolymerase. These nanoparticles are prepared using mechanochemical synthesis. Sizes, structure and composition of the particles are characterized using transmission electron microscopy and x-ray diffraction. The binding of nanoparticles and proteins is confirmed by IR-spectrometry. Functional bionanocomposite based on the superparamagnetic particles of CoFe₂O₄ nanopowder is fabricated. 2008-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/76188 Модель фотоиндуцированных конформационных изменений в реакционных центрах биомолекул Харкянен, В.Н.; Андреев, E.А.; Барабаш, Ю.М.; Мартынчук, Э.Л.; Заболотный, М.А. Исследуются фотоиндуцированные изменения в структуре молекулярного комплекса реакционного центра (РЦ) Rhodobacter sphaeroides в процессе внутримолекулярного переноса электрона. Установлено, что кинетика релаксации фотомобилизационного электрона РЦ имеет S-образный характер зависимости от времени константы скорости возврата электрона с акцептора после выключения возбуждающего света. Предложена двухуровневая модель электронного транспорта. В модели рассматривается совокупность одинаковых, динамичных во времени РЦ, обладающих неэкспоненциальной кинетикой возврата электрона, что обусловлено вязкоупругими свойствами структуры и окружения РЦ. Проведен анализ рентгеноструктурных данных РЦ, находящихся в светоадаптированном и темноадаптированном состояниях. Обсуждается возможная связь медленной компоненты релаксации РЦ с движением деформированной части убихинона Qb в вязкой среде при возврате его в конформацию темноадаптированного состояния.; Досліджуються фотоіндуковані зміни в структурі молекулярного комплексу реакційного центру (РЦ) Rhodobacter sphaeroides у процесі внутрішньомолекулярного перенесення електронів. Встановлено,що кінетика релаксації фотомобілізаційного електрона РЦ має S-подібний характер залежности від часу константи швидкости повернення електрона з акцептора після вимикання збуджуючого світла. Запропоновано дворівневий модель електронного транспорту. У моделю розглядається сукупність однакових, динамічних у часі РЦ, які зазнають неекспоненційну кінетику повернення електрона, що обумовлено в’язкопружніми властивостямиструктури й оточення РЦ. Виконано аналізу рентґеноструктурних даних. РЦ, що перебувають у світлоадаптованім і темноадаптованім станах. Обговорюється можливий зв’язок повільної компоненти релаксації РЦ із рухом деформованої частини убіхінона Qb у в’язкому середовищі при поверненні його в конформацію темноадаптованого стану.; The photoinduced changes in structure of a molecular complex of reactionary centre (RC) of Rhodobacter sphaeroides in the course of intramolecular electron transfer are investigated. As revealed, the relaxation kinetics of RC photomobilization electron possesses S-shaped time dependence of electron return rate from an acceptor after exciting-light switching off. A two-level model of electron transport is proposed. Within this model, a set of identical, dynamical in time RCs is considered. These RCs possess non-exponential electron return kinetics, which is caused by viscoelastic properties of RCs structure and environment. The analysis of x-ray structural data for RCs, which are in light-adapted and dark-adapted states, is carried out. A possible link of RC-relaxation slow component and movement of the Qb ubiquinone deformed part within the viscous environment during its return in dark-adapted state conformation is discussed. 2008-01-01T00:00:00Z