http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151214 2026-04-07T06:08:36Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156498 Чутливість нейродегенеративних мутантів Drosophila melanogaster групи Swiss cheese до умов оксидативного стресу Могиляк, І.І.; Матійців, Н.П.; Груник, Н.І.; Черник, Я.І. Мета. Дослідити чутливість нейродегенеративних мутантів D. melanogaster групи Swiss cheese до умов оксидативного стресу (ОС). Методи. Визначення показників тривалості життя, виживання, вмісту продуктів ПОЛ та кількості дофамінергічних нейронів у гангліях досліджуваних ліній комах за умов ОС. Результати. Виявлено збільшену чутливість до ОС, зниження параметрів середньої та максимальної тривалості життя, інтенсифікацію процесів ПОЛ та дегенерацію дофамінергічних нейронів. Висновки. Нейродегенерація пов’язана з процесами вільнорадикального окиснення, супроводжується накопиченням продуктів ПОЛ та підвищенням чутливості до умов ОС. Ключові слова: дрозофіла, нейродегенерація, дофамін, оксидативний стрес.; Aim. To investigate sensitivity of the D. melanogaster neurodegenerative mutants from Swiss cheese group to oxidative stress (OS). Methods. Measuring the life-span, OS resistance, level of lipid peroxidation products, and the number of dophaminergic neurons. Results. We have found decreased life-span, increased sensitivity to OS, increased formation of LPP and degeneration of dophaminergic neuronsin brain tissue. Conclusions. Neurodegeneration is associated with the free radical oxidation and is accompanied by accumulation of LPP and increased sensitivity to OS. Keywords: drosophila, neurodegeneration, oxidative stress.; Цель. Исследовать устойчивость нейродегенеративных мутантов D. melanogaster группы Swiss cheese к условиям оксидативного стресса (ОС). Методы. Определение показателей продолжительности жизни, устойчивости к ОС, содержания продуктов ПОЛ и количества дофаминэргичных нейронов. Результаты. Выявлено снижение показателей средней и максимальной продолжительности жизни, увеличенную чувствительность к ОС, интенсификацию процессов ПОЛ и дегенерацию дофаминэргичных нейронов. Выводы. Нейродегенерация связана с процессами свободнорадикального окисления, сопровождается накоплением продуктов ПОЛ и повышением чувствительности к условиям ОС. Ключевые слова: дрозофила, нейродегенерация, оксидативный стресс. 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156497 «Фундаментальная биология вышла на плато» – развитие представлений Кордюм, В.А.; Иродов, Д.М.; Маслова, О.А.; Рубан, Т.А.; Сухорада, Е.М.; Шувалова, Н.С.; Лихачева, Л.И.; Шпилевая, С.П. Развивается представление о внутриклеточном транспорте продуктов метаболизма. Оно формируется в виде двух составляющих. Первая в общем виде предложена в предыдущей публикации. В ней обосновано положение о том, что клеточный метаболизм локализован и реализуется не на неподвижных структурах, а на энергично перемещающихся (в основном поступательно – «рысканием») микровезикулах. В настоящей работе продемонстрировано, что при добавлении к мезенхимальным клеткам тетразолия на поверхности рыскающих везикул откладывается формазан. Этот процесс прослежен во времени и показана его динамика. Поскольку образование формазана является общепринятым проявлением метаболизма, то его формирование на везикулах в процессе их движения служит экспериментальным подтверждением протекания метаболизма на подвижных структурах. Вторая составляющая представлена как гипотетическая, что основано на литературных данных о внутриклеточных электропотенциалах и расчетах возможного их участия в прецизионном переносе продуктов метаболизма. Ключевые слова: клеточный метаболизм, микровезикулы, мезенхимальные стволовые клетки, внутриклеточный электропотенциал.; The idea about intracellular transport of metabolic products is presented considering two constituents. The first was described in general in the previous publication. It justified the thesis that cell metabolism is localized and realized not on the fixed structures but on the vigorously and steadily moving («prowling») microvesicles. In the current paper we have shown that an addition of tetrazolium (MTT) to mesenchymal stem cells (MSC) leads to the cumulation of formazan on the surface of actively moving vesicles. This process was time-tracked and shown in dynamics. As formazan is a metabolite product, its formation on the vesicles is an experimental confirmation of the metabolic processes on these moving structures. The second constituent is presented as a hypothesis that is based on the literature data on the intracellular electrical potentials and the calculations of their possible involvement in precision transport of metabolic products. Keywords: cell metabolism, microvesicles, mesenchymal stem cells, intracellular electrical potentials.; Розвивається уявлення про внутрішньоклітинний транспорт продуктів меатболізму, яке формується у вигляді двох складових. Першу в загальному вигляді представлено у попередній публікації, де обгрунтовано положення про те, що клітинний метаболізм локалізується і реалізується не на нерухливих структурах, а на енергійно рухливих (перважно поступально – «нишпорячи») мікровезикулах. У даній роботі продемонстровано, що за додавання до мезенхімальних стовбурових клітин тетразолію на поверхні мікровезикул, які активно рухаються, відкладається формазан. Цей процес відслідковано у часі та показано в динаміці. Оскільки утворення формазану є ознакою метаболізму, то його формування на везикулах експериментально доводить наявність процесів метаболізму саме на поверхні рухливих структур. Другу складову представлено як гіпотетичну. Вона базується на літературних даних про внутрішньоклітинні електропотенціали та розрахунках їхньої можливої участі у прецизійному перенесенні продуктів метаболізму. Ключові слова: клітинний метаболізм, мікровезикули, мезенхімальні стовбурові клітини, внутрішньоклітинні електропотенціали. 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156496 Взаємодія сироваткових альбумінів з кластерними сполуками ренію цис- і транс-конфігурації Леус, І.В.; Кленіна, І.А.; Заблоцька, К.А.; Голіченко, О.А.; Штеменко, О.В.; Штеменко, Н.І. Мета. Вивчити відмінності у взаємодії біядерних кластерних сполук ренію(ІІІ) цис-(I) і транс-(II) конфігурації з альбуміном сироватки бика (BSA) та aльбуміном сироватки крові людини (HSA). Методи. Електронна спектроскопія, триптофанова флуоресценція, круговий дихроїзм. Результати. Показано, що в процесі взаємодії І і ІІ з альбумінами утворюються комплекси із збереженням четверного зв’язку Re–Re та різними характеристиками. Висновки. Зроблено припущення, що транс-ІІ взаємодіє з молекулярним оточенням Trp-214 (HSA) і Trp-212 (ВSA) у гідрофобній кишені субдомену IIА гомологічних білків. Для цис-І характерний складніший механізм взаємодії з альбумінами, що включає не тільки субдомен IIА, а й як мінімум другий сайт зв’язування сполуки ренію у субдомені ІВ. Показано, що I і II по-різному змінюють вторинну структуру гомологічних білків. Ключові слова: сироваткові альбуміни, кластерні сполуки ренію, спектри флуоресценції, електронні спектри поглинання, вторинна структура.; Aim. To investigate differences in the interactions of binuclear cluster rhenium(ІІІ) compounds of cis(I)- and trans(II)-configuration with bovine serum albumin (BSA) and human serum albumin (НSA). Меthods. Electronic spectroscopy, tryptophan fluorescence and circular dichroism spectroscopy. Results. It was shown that in the process of interaction of I and II with proteins different complexes were formed where the quadruple bond Re–Re remained. Conclusions. It is proposed that the trans-isomer interacts with molecular environment of Trp-214 (HSA) and Trp-212 (BSА) in hydrophobic pocket of the IIА subdomain of homological proteins. For the cis-isomer more complex mechanism operatesthat includes not only the subdomain IIА, but also at least one more binding site for the rhenium compound in the subdomain ІВ of the proteins. Different influence of I and II on the secondary structure of homological proteins has been shown. Keywords: serum proteins, cluster rhenium compounds, fluorescent spectra, electronic absorbtion spectra, secondary structure.; Цель. Изучить различия во взаимодействии биядерных кластерных соединений рения(III) цис-(I) и транс-(II) конфигураций с бычьим сывороточным альбумином (BSA) и сывороточным альбумином человека (HSA). Методы. Электронная спектроскопия, триптофановая флуоресценция, круговой дихроизм. Результаты. Показано, что в процессе взаимодействия I и II с альбуминами происходит образование различных комплексов, где четверная связь Re–Re сохраняется. Выводы. Сделано предположение о том, что II взаимодействует с молекулярным окружением Trp214 (HSA) и Trp-212 (BSA) в гидрофобном кармане субдомена IIА гомологичных белков. Для I характерен более сложный механизм взаимодействия с альбуминами, включающий не только субдомен IIА, но и как минимум второй сайт связывания соединения рения в субдомене ІВ. Показано, что I и II по-разному изменяют вторичную структуру гомологичных альбуминов. Ключевые слова: сывороточные альбумины, кластерные соединения рения, спектры флуоресценции, электронные спектры поглощения, вторичная структура. 2011-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156495 Локалізація сайтів 5'-CG-3' , 5'-CNG-3' , 5'-GC-3' та 5'-GNC-3' у послідовностях мікроРНК Галицький, В.А.; Комісаренко, С.В. Мета. Встановлення закономірностей у локалізації динуклеотидів 5'-CG-3' та тринуклеотидів 5'- CNG-3' у послідовностях мікроРНК (miRNA). Методи. Біоінформатичний та статистичний аналіз послідовностей зрілих miRNA. Результати. Один із найвищих піків концентрації сайта 5'-CG-3' локалізується у місці розташування нуклеотиду 10 з 5'-кінця miRNA. Рівень концентрації сайта 5'-CG-3' у даному піку більш ніж учетверо перевищує середню концентрацію даного динуклеотиду у геномі. Інші еволюційно консервативні піки у послідовності miRNA локалізуються в районі нуклеотидів 16 та 21. Піки концентрації сайта 5'-CNG-3 відповідають нуклеотидам 4 і 8. Приблизно половина послідовностей miRNA містить два чи більше сайтів 5'-CG-3' та 5'- CNG-3', відстань між якими становить у більшості випадків 1 або 3–9 нуклеотидів. Висновки. Піки концентрації сайтів 5'-CG-3' і 5'-CNG-3' не зосереджені в межах seed-ділянки, а розподілені уздовж усієї послідовності miRNA. Однак в одній і тій же молекулі miRNA дані сайти розташовані в межах одного витка подвійної спіралі. Така картина розподілу зазначених сайтів може вказувати на участь у miRNA-залежному метилюванні ДНК усієї послідовності miRNA. Ключові слова: мікроРНК, динуклеотид 5'-CG-3', тринуклеотид 5'-CNG-3', розподіл сайтів.; Aim. Discovery of localization pattern of 5'-CG-3' dinucleotide and 5'-CNG-3' trinucleotide in microRNA (miRNA) sequences. Methods. Bioinformatic and statistic analysis of mature miRNA sequences. Results. One of the highest peaks of 5'-CG-3' dinucleotides concentration is located close to the nucleotide 10 from 5'-end of miRNA. The level of 5'-CG-3' in thіs peak exceeds more than four times the average genomic frequency of this dinucleotide. Other evolutionary conservative peaks are located around the nucleotides 16 and 21 in miRNA sequence. Peaks of 5'-CNG-3' trinucleotides concentration correspond to the nucleotides 4 and 8. Approximately 50 % of miRNA sequences contain two or more 5'-CG-3' or 5'- CNG-3' sites. The distance between these sites amounts mostly to 1 or 3–9 nucleotides. Conclusions. The peaks of 5'-CG-3' and 5'- CNG-3' sites concentration are located not only within seed region, but also along the full length of miRNA sequence. Nevertheless, these sites are disposed in the same miRNA molecule mainly within one turn of double helix. Such site localization pattern may be an evidence of participation of the whole miRNA sequence in miRNAdependent DNA methylation. Keywords: microRNA, 5'-CG-3' dinucleotide, 5'-CNG-3' trinucleotide, site pattern.; Цель. Установление закономерностей в локализации динуклеотидов 5'-CG-3' и тринуклеотидов 5'- CNG-3' в последовательностях микроРНК (miRNA). Методы. Биоинформатический и статистический анализ последовательностей зрелых miRNA. Результаты. Один из наиболее высоких пиков концентрации сайта 5'-CG-3' локализуется в месте расположения нуклеотида 10 с 5'-конца miRNA. Уровень концентрации сайта 5'-CG-3' в данном пике более чем в четыре раза превышает среднюю концентрацию этого динуклеотида в геноме. Другие эволюционно консервативные пики в последовательности miRNA локализуются в районе нуклеотидов 16 и 21. Пики концентрации сайта 5'-CNG-3 соответствуют нуклеотидам 4 и 8. Приблизительно половина последовательностей miRNA содержит два или больше сайтов 5'-CG-3' или 5'-CNG-3', расстояние между которыми в большинстве случаев составляет 1 или 3–9 нуклеотидов. Выводы. Пики концентрации сайтов 5'-CG-3' и 5'-CNG-3' не сосредоточены в пределах seed-участка, а распределены по всей длине последовательности miRNA. Однако в одной и той же молекуле miRNA данные сайты расположены в пределах одного витка двойной спирали. Такая картина распределения упомянутых сайтов может указывать на участие в miRNA-зависимом метилировании ДНК всей последовательности miRNA. Ключевые слова: микроРНК, динуклеотид 5'-CG-3', тринуклеотид 5'-CNG-3', распределение сайтов. 2011-01-01T00:00:00Z