http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151126 2026-04-07T03:08:57Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156871 Структурные характеристики интеркаляционного комплекса шпилечной формы дезоксигептануклеотида d(GCGAAGC) с антрациклиновым антибиотиком дауномицином Костюков, В.В.; Пахомов, В.И.; Дымант, Л.Н. Методами одно- и двухмерной ¹H ЯМР-спектроскопии и молекулярной механики исследован интеркаляционный комплекс шпильки дезоксигептануклеотида d(GCGAAGC) с антрациклиновым антибиотиком дауномицином в водно-солевом растворе. Определены равновесные термодинами­ческие параметры комплексообразования, рассчитана пространственная структура комплекса, проведен сравнительный анализ конформационных и энергетических параметров шпильки гептамера без лиганда и в составе комплекса. Изучена молекулярная динамика комплекса в наносекундном временном интервале, оценена подвижность его структурных элементов. Проанал; Методами одно- та двовимірної ¹H ЯМР-спектроскопи і молекулярної механіки досліджено інтеркаляційний комплекс шпильки дезоксигептануклеотиду d(GCGAAGC) з антрациклі­новим антибіотиком дауноміцином у водно-сольовому розчині. Визначено рівноважні термодинамічні параметри комплексоутворення, розраховано просторову структуру комплексу, проведено порівняльний аналіз конформаційних та енергетич­них параметрів гептамеру без ліганду та в складі комплексу. Вивчено молекулярну динаміку комплексу у наносекундному часовому інтервалі, оцінено рухливість його структурних елементів. Проаналізовано взаємодію комплексу з найближчим водним оточенням.изировано взаимодействие комплекса с ближайшим водным окружением.; The investigation of intercalation complex of deoxyheptanucleotide d(GCGAAGC) hairpin and anthracycline antibiotic daunomycin (DAU) in aqueous-saline solution has been performed by one- and two-dimensional ¹H NMR spectroscopy and molecular mechanics methods. The equilibrium thermodynamic parameters of complexation have been obtained. The spatial structure of the complex has been calculated and the comparative analysis of conformational and energetic parameters of associated and free heptamer hairpin has been carried out. The molecular dynamics of the complex in nanosecond time scale has been studied and mobility of structure elements has been evaluated. The interaction of the complex of heptamer-DAU with nearest hydration shell has been analyzed. 2006-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156870 Вичерпний конформаційний аналіз 2-дезоксиуридину квантово-хімічним методом функціоналу густини Жураківський, Р.О.; Говорун, Д.М. Вперше квантово-хімічним методом функціоналу густини на рівні теорії МР2/6-311++G(d, p)/DFT B3LYP/6-31G(d, р) проведено вичерпний конформаційний аналіз 2'-дезоксиуридину, мінорного нуклеозиду. Представлено основні геометричні, енергетичні та полярні характеристи­ ки усіх його 94 стійких конформерів, а також конформаційні рівноваги за нормальних умов.; The comprehensive conformational analysis of minor nucleoside 2'-deoxyuridine is first performed by means of quantum-chemical density functional method on MP2/6-311++G(d, p)//DFT B3LYP/6-31G(d, p) theory level. The main geometric, energetic, and polar characteristics are presented for all of its 94 stable conformers as well as conformational equilibriums at normal conditions; Впервые квантово-химическим методом функционала плотно­сти на уровне теории МР2/6-311++G(d, p)/DFT B3LYP/6-31G(d, р) проведен исчерпывающий конформационный анализ 2'-дезоксиуридина, минорного нуклеозида. Представлены ос­новные геометрические, энергетические и полярные характе­ристики всех его 94 устойчивых конформеров, а также конформационные равновесия при нормальных условиях. 2006-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156869 Влияние хлороформа на состояние воды, адсорбированной сывороточным альбумином Нечипор, О.В.; Гунько, В.М.; Барвинченко, В.Н.; Туров, В.В. Методом ¹H ЯМР спектроскопии с вымораживанием жидкой фазы изучено строение гидратной оболочки лиофилизированного и сорбированного на поверхности высокодисперсного кремнезема сывороточного альбумина человека, находящегося в слабополярном растворителе (хлороформе) или при его добавлении к гидратированной системе. Показано, что влияние хлороформа может приводить к изменению объемов внутренних областей белковой глобулы, характеризующихся различной гидрофильностью и заполненных структурированной водой, которая не замерзает при Т< 273 К.; Методом ¹H ЯМР спектроскопії з виморожуванням рідкої фази вивчено будову гідратної оболонки ліофілізованого і сорбованого на поверхні високодисперсного кремнезему сироват­кового альбуміну людини, що знаходиться в слабополярному розчиннику (хлороформі) або при його додаванні до гідратованої системи. Показано, що вплив хлороформу може спри­чинювати зміну об'ємів внутрішніх областей білкової глобули, які характеризуються різною гідрофільністю і заповнених структурованою водою, що не замерзає за температури Т < 273 К.; The hydrate shell structure of dry human serum albumin and albumin adsorbed on a surface of highly disperse silica in a weakly polar solvent (chloroform) or with addition of this solvent was studied by ¹H NMR spectroscopy with layer-by-layer freezing out of a liquid phase. The influence of chloroform can result in changes in the ratio of volumes of internal regions of protein globule characterized by different hydration level and filled up with structured water unfrozen at T < 273K. 2006-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156868 Исследование инфракрасного спектра 17β-эстрадиола квантово-химическим методом функционала плотности Минаев, Б.Ф.; Минаева, В.А. Квантово-химическим методом функционала плотности на уровне теории B3LYP/6-31G** рас­считаны частоты и интенсивности колебаний в ИК спектре молекулы женского полового гормона 17β-эстрадиола и выполнено их отнесение. Для многих полос такая интерпретация сделана впервые. Также впервые предсказаны частоты и формы низкочастотных колебаний. Кратко обсуждается биологическое значение полученных результатов.; The frequency and intensity of IR absorption bands of female sex hormone, 17?-estradiol, are calculated and assigned using density functional theory with the B3LYP/6-31G** approach. For a big number of bands such assignment is made for the first time. The frequencies and normal modes of vibrations are predicted in the low-frequency region of the IR spectrum.; Квантово-хімічним методом функціоналу густини на рівні теорії B3LYP/ G-31G** розраховано частоти та інтенсив­ності коливань в 14 спектрі молекули жіночого статевого гормону 17β-естрадіолу та виконано їхнє віднесення. Для багатьох смуг таку інтерпретацію здійснено вперше. Також вперше передбачено частоти і форми низькочастотних коли­вань. Коротко обговорюється біологічне значення отриманих результатів. 2006-01-01T00:00:00Z