http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151117 2026-04-20T16:09:30Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155662 Ідентифікація ендогенних ізоформ кінази рибосомного білка S6 – S6K2 Панасюк, Г.Г.; Немазаний, І.О.; Гут, І.Т.; Філоненко, В.В. До родини кіназ рибосомного білка S6 належать два представники — S6K1 і S6K2. Перший функціонує в клітині у вигляді двох ізоформ — цитоплазматичної (S6KI/II, 70 кДа) і ядерної (S6K1/I, 85 кДа), яка містить сигнал ядерної локалізації в межах N-кінцевого подовження. Вважається, що ізоформи S6K1 виникають як результат альтернативного сплайсингу мРНК або ж використання альтернативних стартів трансляції мРНК. Відомо, що S6KІ/II залучена до регуляції біогенезу рибосом через контроль трансляції мРНК рибосомних білків. Функцію S6K1/1 на сьогодні не досліджено. Високий рівень структурної гомологи S6K1 і S6K2 і присутність двох альтернативних стартів трансляції мРНК свідчать про те, що S6K2 (як і S6K1) може існувати у вигляді двох ізоформ. Вестерн-блот-аналізом лізатів клітин з використанням поліклональних антитіл проти S6K2 не виявлено S6K2/I ізоформи очікуваної молекулярної маси (-70 кДа). Натомість за допомогою анти-S6K2 антитіл детектовано як S6K2/II, так і білковий продукт розміром 105 кДа.; Семейство киназ рибосомного белка S6 включает двух пред­ставителей – S6K1 и S6K2. Первый функционирует в клетке в виде двух изоформ – цитоплазматической (S6K1/II, 70 кДа) и ядерной (S6K1/I, 85 кДа), содержащей сигнал ядерной локализации в рамках N-концевого удлинения. Счита­ется, что S6K1 изоформы возникают в результате альтернативного сплайсинга мРНК или же использования альтерна­тивных стартов трансляции. S6K1/II участвует в регуляции биогенеза рибосом, контролируя трансляцию мРНК рибосомных белков. Функции S6K1/I на сегодня не изучены. Высокий уровень структурной гомологии S6KI и S6K2 свидетельству­ет о том, что S6K2 (аналогично S6K1) существует в виде двух изоформ. Вестерн-блот-анализом лизатов клеток и гомогенатов тканей с использованием поликлональных антител против S6K2 не выявлена S6K2/I форма с ожидаемой молекулярной массой (-70 кДа). Однако с помощью анти-S6K анти­тел детектирован белковый продукт размером 105 кДа.; S6K1 and S6K2 belong to the family of ribosomal protein S6 kinases. S6K1 has two isoforms - cytoplasmic (S6K1/II, 70 kDa) and nuclear (S6K1/I, 85 kDa) possessing nuclear localization signal within the N-terminal extension region. It is believed that S6K1 isoforms are generated from a single gene by alternative mRNA splicing or the use of alternative translational start sites. S6K1/II is implicated in ribosomal biogenesis via regulation of ribosomal proteins mRNAs translation. The function of S6K1/I is not clear. The high level of structural homology between S6K1 and S6K2 suggest that S6K2 has two isoforms as well, but Western blot analysis of cell lysates and tissue homogenates does not reveal S6K2/1 with expecting molecular mass (~70 kDa). However, 105 kDa protein has been detected by anti-S6K2 polyclonal antibodies. 2005-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155661 Evaluation of 4H-4-chromenone derivatives as inhibitors of protein kinase CK2 Prykhodko, A.O.; Yakovenko, O.Ya.; Golub, A.G.; Bdzhola, V.G.; Yarmoluk, S.M. Protein kinase CK2 (Casein Kinase 2) is a ubiquitous serine/threonine protein kinase involved in various cell signal transduction pathways. Thus, CK2 is a new perspective target for anticancer drugs. The receptor-based virtual screening of 2000 compounds from combinatorial library of 4H-4-chromenones has been carried out in search for CK2-inhibitors. 90 compounds have been chosen for biological testing based on the score values calculated by DOCK 4.0 software. It has been revealed, that 3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)-7-(4-methoxyphenylcarbonyloxy)-4-oxo-4H-chromene (12) and 7-(4-fluorophenylcarbonyloxy)-4-oxo-3-(4-phenylphenoxy)-4H-chromene (14) inhibit CK2 activity with IC50= 18.8 mM and IC50=22.4 mM, respectively.; Протеїнкіназа СК2 є убіквітальною багатосубстратною кіна­зою, що залучена до багатьох сигнальних шляхах клітинного росту та проліферації. СК2 кіназа розглядається як перспек­тивна мішень для створення протиракових ліків. Для пошуку інгібіторів протеїнкінази СК2 нами проведено комп'ютерний рецептор-орієнтований віртуальний скринінг 2000 сполук ком­бінаторної бібліотеки 4Н-4-хроменону. На основі розрахованих програмою DOCK 4.0 оціночних показників вільної енергії взаємодії відібрано 90 сполук для біологічного тестування. Знайдено, що дві сполуки пригнічують активність СК2 кінази з ІС50 - 18,8 мкМ та IC50 - 22,4 мкМ.; Protein kinase CK2 (Casein Kinase 2) is a ubiquitous serine/threonine protein kinase involved in various cell signal transduction pathways. Thus, CK2 is a new perspective target for anticancer drugs. The receptor-based virtual screening of 2000 compounds from combinatorial library of 4H-4-chromenones has been carried out in search for CK2-inhibitors. 90 compounds have been chosen for biological testing based on the score values calculated by DOCK 4.0 software. It has been revealed, that 3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)-7-(4-methoxyphenylcarbonyloxy)-4-oxo-4H-chromene (12) and 7-(4-fluorophenylcarbonyloxy)-4-oxo-3-(4-phenylphenoxy)-4H-chromene (14) inhibit CK2 activity with IC50= 18.8 mM and IC50=22.4 mM, respectively. 2005-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155660 О молекулярных механизмах сокращения мышечного волокна при переходе к новому равновесному состоянию: анализ экспериментальных данных с использованием трехкомпонентного электростимулирующего сигнала Ноздренко, Д.Н.; Богуцкая, Е.И. Экспериментально обнаружено, что при сокращениях мышечного волокна при переходе из нативного состояния покоя вовлекаются более сложные молекулярные механизмы по сравнению с сокращением из состояния предварительного напряжения волокна. Использование трехкомпонен­тного электростимулирующего сигнала позволило выявить нелинейность динамических процессов на временном отрезке соответствующей фазы дотетанического сокращения. Возможно, что скольжение актиновых и миозиновых протофибрилл, имеющих предысторию движения, происхо­дит с образованием прочных связей головок миозина с актином, начало формирования которых относится к сокращению, вызванному из нативного состояния покоя. Выявленные нелинейные характеристики динамики сокращения мышцы свидетельствуют о трудностях, связанных с созданием адекватной микроструктурной модели мышечного сокращения.; Експериментально виявлено, що при скороченнях м'язового волокна при переході з нативного стану спокою залучаються складніші молекулярні механізми скорочення порівняно із ско­роченнями зі стану попереднього напруження волокна. Засто­сування трикомпонентного електростимулювального сигналу дозволило визначити нелінійність динамічних процесів на ча­совій ділянці відповідної фази дотетанічного скорочення. Мож­ливо, що ковзання актинових та міозинових протофібрил, які мають передісторію руху, проходить з утворенням міцних зв'язків головок міозину з актином, початок формування якихналежить до скорочення, викликаного з нативного стану спокою. Виявлені нелінійні характеристики в динаміці скоро­чення м'яза свідчать про труднощі, пов'язані зі створенням адекватної мікроструктурної моделі м'язового скорочення.; Molecular mechanisms of muscular fiber contraction from native conditions of rest are found to be more complex in comparison with those from conditions of preliminary pressure. An application of three-component electrical stimulating signal has revealed non-linearity of dynamic processes during an appropriate phase before tetanus contraction. It is possible that the slipping of actin and myosin protofibrils occurs with the formation of strong bounds of myosin heads with actin, which starts at the contraction from the rest state. The revealed non-linear dynamic characteristics of muscle contraction proof the complexities in creation of its adequate microstructural model. 2005-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/155659 Потенціометричний біосенсор для визначення глікоалкалоїдів картоплі: керована зміна аналітичних характеристик, порівняння з методом тонкошарової хроматографії Назаренко, О.А.; Солдаткін, О.П.; Сосовська, О.Ф.; Бенілова, І.В.; Корпан, Я.І. Щоб спрямовано змінювати аналітичні характеристики біосенсорів на основі рН-чутливих польових транзисторів (рН-ПТ) та іммобілізованої бутирилхолінестерази (БуХЕ) для визначення стероїдних глікоалкалоїдів картоплі запропоновано використання БуХЕ різного походження та варіювати час іммобілізації ферменту на поверхні потенціометричних перетворювачів. Показано, що застосування етилендіамінтетраацетату (комплексон іонів важких металів) і фосфотриестерази (фермент, який здатний розщеплювати винятково фосфороорганічні пестициди) дозво­ляє селективно визначати глікоалкалоїди на фоні іонів важких металів та фосфороорганічних пестицидів. За допомогою біосенсора і методу тонкошарової хроматографії протестовано 14 сортів картоплі, які культивуються на території України, та показано, що значення кореляції між даними, отриманими цими методами, складає 0,74.; Чтобы направленно изменять аналитические характеристики биосенсоров на основе рН- чувствительных полевых транзи­сторов и иммобилизованной бутирилхолинэстеразы (БуХЭ) для определения гликоалкалоидов картофеля предложено ис­пользование БуХЭ различного происхождения и варьированиевремени иммобилизации фермента на поверхности потенциометрических преобразователей. Показано, что применение этилендиаминтетраацетата (комплектна ионов тяжелых металлов) и фосфотриэстеразы (фермента, способного рас­щеплять исключительно фосфороорганичские пестициды) по­зволяет селективно определять гликоалкалоиды на фоне ионов тяжелых металлов и фосфороорганических пестицидов. С помощью биосенсора и метода тонкослойной хроматографии протестированы 14 сортов картофеля, культивирующегося на территории Украины, и показано, что значение корреляции между данными, полученными этими методами, составляет 0,74.; Butyrylcholinesterase (BuChE) of different origin along with variations of the time of the enzyme immobilization on the potentiometric transducer surface are offered to control analytical characteristics of the biosensor, based on pH-sensitive field effect transistor with immobilized BuChE, for detection of the potato glycoalcaloids. Utilization of ethylendiaminetetracetate (a complexon of heavy metal ions) and phosphotriesterase (an enzyme capable of exclusive disintegration of phosphororganic pesticides) is shown to enable the selective determination of glycoalcaloids at the background of heavy metal ions and phosphororganic pesticides. 14 potato varieties cultivated in Ukraine have been tested by the biosensor and thin-layer chromatography the correlation between both methods being 0.74. 2005-01-01T00:00:00Z