http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151085 2026-04-12T01:21:25Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156384 Взаємодія ціанінових барвників з нуклеїновими кислотами. Механізм взаємодії монометинового ціанінового барвника Cyan 40 з двоспіральною ДНК: дослідження методами комп'ютерного моделювання Яковенко, О.Я.; Голуб, А.Г.; Лосицький, М.Ю.; Бджола, В.Г.; Ярмолюк, С.М. Механізм взаємодії ціанінового барвника Cyan 40 з молекулами ДНК вивчено методами комп'ю­терного моделювання. Оцінено енергію взаємодії термінальних частин ππ-електронних хмар гетероциклічних кілець нуклеотидних основ ДНК та барвника Cyan 40 методами ab initio. Запропоновано механізм взаємодії Cyan 40 з молекулами ДНК відповідно до моделі повної інтеркаляції. На основі комбінованих розрахунків методами Amber, ММ+, AM J, РМЗ та ab initio доведено енергетичну вигідність зв'язування Cyan 40 з ДНК за механізмом повної інтеркаляції порівняно з механізмом напівінтеркаляції. Знайдено ряд метастанів, що ілюструють гіпотезу послідовної взаємодії Cyan 40 з ДНК в три етапи: асоціація з ДНК у малій борозенці, взаємодія з ДНК за типом напівінтеркаляції бензотіазоловим кільцем та остаточна фіксація Cyan 40 між парами основ ДНК за механізмом повної інтеркаляції.; Механизм взаимодействия цианинового красителя Cyan 40 с молекулами ДНК изучен методами компьютерного моделирования. Оценена энергия взаимодействия терминальных тетей π-электронных облаков гетероциклических колец нуклеотидных оснований ДИК и красителя Cyan 40 методами ab initio. Предложен механизм взаимодействия Cyan 40 с молекулами ДНК согласно модели полной интеркаляции. На основании комбинированных расчетов методами Amber, ММ+, AMU РМЗ и ab initio доказана энергетическая выгодность связыва­ния Cyan 40 с ДНК по механизму полной интеркаляции по сравнению с механизмом полу интеркаляции. Найден ряд метасостояний, иллюстрирующих гипотезу последовательного взаимодействия Cyan 40 с ДНК в три этапа: ассоциация с ДНК в малой бороздке, взаимодействие с ДНК по типу полуинтеркаляции бензотиазоловым кольцом и окончательная фиксация Cyan 40 между парами оснований ДНК по механизму полной интеркаляции.; The mechanism of interaction of cyanine dye Cyan 40 and DNA was studied by molecular modelling methods. The energy of interaction of the terminal parts of π-electrons clouds of aromatic heterocycles of DNA bases with Cyan 40 molecule was calculated by ab initio methods. We supposed that Cyan 40 interacted with dsDNA according to full-intercalation binding mode. Using combination of Amber, MM+, AMI, PM3 and ab initio calculation methods, the full-intercalation interaction of Cyan 40 with DNA was proved to be more favourable energetically than half-intercalation one. The series of the dye-DNA complex metastates were found, illustrating the hypothesis of three consequent stages of Cyan 40 interaction with DNA: (1) association of Cyan 40 with DNA minor groove, (2) interaction by half-intercalation mechanism, and (3) fixation of Cyan 40 between DNA bases pairs by the mechanism of full-intercalation. 2003-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156383 Пам'яті професора Саула Бенціоновича Серебряного 15 грудня 2002 року виповнилося 90 років від дня народження Саула Бенціоновича Серебряного — доктора хімічних наук, професора, заслуженого діяча науки і техніки СРСР, лауреата Державної премії України в галузі науки і техніки. 2003-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156382 Трофинотропин «Церебрал» — эндогенный нейроиммунопротектор, индуцирующий выработку γ-интерферона Макаренко, А.Н.; Рыбалко, С.Л. Представлены результаты изучения интерферониндуцирующего действия эндогенного регулятора ростовых факторов центральной нервной системы трофинотропина «Церебрала» на продуцирование интерферона лейкоцитами крови человека. Показано, что низкомолекулярные факторы препарата «Церебрала» индуцируют γ-интерферон в титрах 160–320 ME/мл, что, по-видимому, определяет механизм коррекции нарушений иммунной системы, развивающихся при остром геморрагическом инсульте.; Представлено результати вивчення інтерфероніндукуючої дії ендогенного регулятора ростових факторів центральної нер­вової системи трофінотропіну «Церебралу» на продукування інтерферону лейкоцитами крові людини. Показано, що низько­молекулярні фактори препарату «Церебралу» індукують γ- інтерферон у титрах 160–320 ME/мл, що, скоріш за все, визначає механізм корекції порушень імунної системи, які розвиваються при гострому геморагічному інсульті; Interferon-inducing activity of «Cerebral», endogenous trophinotropin agent, controlling growth factors of CNS, has been evaluated in human blood leukocytes. «Cerebral» has been shown to induce γ-interferon at a titer of 160–320 IU/ml. Interferon-inducing activity of «Cerebral» may contribute to the correction mechanisms of immune disorders in patients with acute hemorrhagic stroke. 2003-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156371 Особенности экспрессии целевого гена в составе вектора на основе бактериофага лямбда и изучение путей ее оптимизации Славченко, И.Ю.; Шмидт, В.А.; Черных, С.И.; Кордюм, В.А. Рекомбинантные молекулы на основе бактериофага лямбда отличаются высокой сегрегационной стабильностью в лизогенном состоянии и высоким уровнем амплификации фаговой ДНК и соответственно встроенного в нее целевого гена при литическом развитии фага, которое заканчивается лизисом бактериальной клетки и высвобождением целевого продукта в культуральную среду. Это делает перспективным использование фага лямбда для получения рекомбинантных белков. В данном сообщении описано конструирование фага λpIF, несущего две копии искусствен­ного гена интерферона (ИФН) человека под контролем тандема триптофановых промоторов. Экспрессию чужеродных генов осуществляли термоиндукцией клеток, несущих фаг с генами ИФН, а также инфекцией этим фагом реципиентных клеток. Показано, что выход рекомбинантного белка зависит от оптической плотности клеток при термоиндукции и последующего темпера­турного режима культивирования продуцента Увеличение содержания ИФН в лизатах после индукции также наблюдали при использовании Q–R– амбер-мутантов фага λpIF. Показано, что инфицирование реципиентных клеток фагом λpIF обеспечивало более высокий выход ИФН (около 40 мг/л), чем термоиндукция клеток Escherichia coli, несущих фаг с целевыми генами.; Рекомбінантні молекули на основі бактеріофага лямбда відріз­няються високою сегрегаційною стабільністю у лізогенному стані і високим рівнем ампліфікації фагової ДНК та від­повідно вбудованого в неї цільового гена за літичного розвитку фага, який закінчується лізисом бактеріальної клітини і вивільненням цільового продукту в культуральне середовище. Це робить перспективним використання фага лямбда для отримання рекомбінантних білків. У даному повідомленні описано конструювання фага λpIF, який несе дві копії штучно­го гена інтерферону (ІФН) людини під контролем тандему триптофанових промоторів. Експресію чужорідних генів здій­снювали термоіндукціею клітин, які несуть фаг з генами ІФН, а також інфекцією цим фагом реципієнтних клітин. Показано, що вихід рекомбінантного білка залежить від оп­тичної густини клітин при термоіндукції і наступного тем­пературного режиму культивування продуцента. Збільшення вмісту ІФН у лізатах після індукції також спостерігали при використанні Q– R– амбер-мутантів фага λpIF. Показано, що інфікування реципієнтних клітин фагом λpIF забезпечує ви­щий вихід ІФН (біля 40 мг/л), ніж термоіндукиія клітин Escherichia coli, які несуть фаг з цільовими генами.; High stability of the cloned gene in the lysogenic state and high copy number in the lytic state suggest a potential use of phage λ as an expression vector for overproduction of the extracellular recombinant proteins which release to the growth medium as a result of lysis of E. coli cells by phage. This paper describes the construction and characterization of phage λpIF carrying the two copy of an artificial gene for human α2 interferon (IFN) under control of the Ptrp tandem promoter. The expression of the foreign genes realized by thermal induction cells carrying the phage λpIF as well as by infection of recipient cells with this phage. In this study it was shown that the recombinant protein yield is dependent on a cell density at the time of thermal induction and the following temperature of producer cultivation. The increase of soluble target protein concentration in lysates after induction of recombinant phage was also observed using the phage λpIF contains amber-mutations in genes Q and R. The infection of recipient cells by phage λpIF resulted in higher IFN yield (about 40 mg per l) than thermal induction of the cells carrying the phage λ with target genes. 2003-01-01T00:00:00Z