http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/151042 2026-04-12T22:56:22Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156341 Анализ взаимодействия антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водном растворе методом ЯМР-спектроскопии Веселков, А.Н.; Итон, Р.Дж.; Барановский, С.Ф.; Осетров, С.Г.; Пахомов, В.И.; Болотин, П.А.; Дымант, Л.Н.; Дэвис, Д.Б. Методом одномерной и двухмерной (2M-TOCSY и 2M-NOESY) гомоядерной ПМР-спектроскопии и гетероядерной 2М-¹H- ³¹Р-ЯМР-спектроскопии (500 МГц) исследовано комплексообразование антибиотика дауномицина с дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) в водно-солевом растворе. По измеренным концентрационным и температурным зависимостям протонных химических сдвигов молекул рассчитаны равновесные константы реакций, относительное содержание различ­ных типов комплексов в зависимости от концентраций и температуры и термодинамические параметры ΔH и ΔS комплексообразования молекул. Анализ полученных результатов позволяет сделать вывод о том, что местами преимущественной посадки дауномицина являются триплеттне нуклеотидные последовательности. Связывание второй молекулы дауномицина. как с одоцепочечной, так и с дуплексной формой тетрамера носит выраженный антикооперативный характер. Построена наиболее вероятная пространственная структура комплекса 1:2 антибиотика с дезокситетрануклеотидом по расчетным значениям предельных значений химических сдвигов протонов дауномицина в составе комплекса и данным 2M-NOE.; Методом одновимірної і двовимірної (2M-TOCSY і 2M-NOESУ) гомоядерної ПМР-спектроскопіі та гетероядерної 2М- ¹Н- ³¹ Р-ЯМР-спектроскопії (500 МГц) досліджено комплексоутво­ рення антибіотика дауноміцина з дезокситетрануклеотидом 5'-d(TpGpCpA) у водно-сольовому розчині. За виміряними концентраційними і температурними залежностями протонних хімічних зсувів молекул розраховано рівноважні константи реакцій, відносний вміст різних типів комплексів у залежності від концентрацій і температури та термодинамічні пара­метри ΔH і ΔS комплексоутворення молекул. Аналіз отрима­них результатів дозволяє зробити висновок стосовно того, що місцями переважної посадки дауноміцина с триплетні нуклеотидні послідовності. Зв'язування другої молекули дау­номіцина як з одноланцюговою, так і з дуплексною формою тетрамера має виражений антикооперативний характер. По­будовано найвірогіднішу просторову структуру комплексу 1:2 антибіотика з дезокситетрануклеотидом за розрахунковими значеннями граничних значень хімічних зсувів протонів дау­номіцина у складі комплексу і даними 2M-NOE.; One-dimentional and two-dimentional (2D-TOCSY and 2D-NCJESY) homonuclear H NMR spectroscopy and heteronuclear 2D- ¹H-³¹P-NMR spectroscopy have been used to investigate the comple-xation of the antibiotic daunomycin with deoxytetranucleotide 5'-d(TpGpCpA) in aqueous salt solution. The equilibrium reaction constants, relative content of different types of complexes as a function of concentration and temperature of solution and thermo-dynamical parameters ΔH and ΔS of complexation of the molecules have been calculated using experimental concentrational and temperature dependences of the proton chemical shifts of the interacting molecules. Analysis of the results has shown that the most favourable binding sites for daunomycin are triplet nucleotidc sequences. Binding of the second daunomycin molecule with both single-stranded and duplex forms of the tetranucleotide is highly anticooperative. The most favourable structure of 1:2 antibiotic-deoxy-tetranudeotide complex has been constructed using the calculated limiting proton chemical shifts of daunomycin protons in the' intercalated complex and 2D-NOE data. 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156330 Діелектрометричні дослідження впливу ультрафіолетового випромінювання на водні розчини азотистих основ нуклеїнових кислот Чічак, С.О.; Суховія, М.І.; Кикинеші, О.О. Досліджено дисперсію діелектричних характеристик азотистих основ нуклеїнових кислот- імпе­дансу, комплексної діелектричної проникності, тангенса кута діелектричних втрат, ємності В інтервалі частот 10²–10⁶ Гц отримано діаграми Коул Коула. Виявлено зміни релаксуючих структур піримідинових основ після дії ультрафіолетового випромінювання.; Исследована дисперсия диэлектрических характеристик азо­тистых оснований нуклеиновых кислот импеданса, комплекснон диэлектрической проницаемости, тангенса угла Диэлект­рических потерь, емкости, В интервале частот 10² –10⁶ Гц получены диаграммы Коул-Коула. Выявлено изменение релаксирующих структур пиримидиновых оснований после воздей­ствия ультрафиолетового излучения,; Dispersion of the dielectric properties of nucleic acid bases: impedance, complex dielectric constants, dielectric losses, capacity are studied. Cole-Cole diagrams are obtained in the frequency range 10² – 10⁶ Hz. The variation of the relaxation structures of pyrimidine bases are shown under the ultraviolet radiation influence. 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156329 Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase Kornelyuk, A.; Tas, M.; Dubrovsky, A.; Murray, J.C. Cytokine activity of the isolated recombinant C-terminal domain of mammalian lyrosyl-tRNA synthetasg (TyrRS), which is homologous to a tumor-derived cytokine, endothelial and monocyte activating polypeptide (EMAP-2) has been studied. It was shown that C-domain induced a ~ 2-fold increase of monocyte chemotaxis. This effect is comparable with the values of chemotaxis induction by EMAP-2 cytokine and proEMAP-2. The truncated catalytic form of bovine TyrRS (2 x 39 kDa) lias no effect on monocyte chemotaxis. C-domain of TyrRS also induced a ~ 3-fold increase in tissue factor activity in cultured human endothelial cells. A hypothesis is forwarded that the isolated C-domain of mammalian TyrRS may be released at proteoiytic cleavage of TyrRS by some protease, activated ui stress conditions, and functions as a mediator via signal transduction through interaction with a putative EMAP-2 receptor.; Досліджено цитокінову активність ізольованого рекомбінантного С-кінцевого домена тирозил-тРНК синтетази (тирРС) ссавців, гомологічного ЕМАР-2 цитокіну. Показано, що С-домен індукує збільшення хемотаксису моноцитів у 2 рази. Цей ефект близький до такого, спричиненого ЕМАР-2 та ргоЕМАР-2. Протеолітично модифікована каталітична фор­ма тирРС (2 у- 39 кДа) не впливала на хемотаксис моноцитів. С-домен тирРС також індукує зростання активності тка­нинного фактора ендотеліальних клітин людини в 3 рази. Пропонується гіпотеза стосовно того, що ізольований С-до­мен може вивільнятися при протеолітичному розщепленні тирРС певною протеазою, яка активується в стресових умовах, і функціонувати як медіатор шляхом передачі сигналу при взаємодії з рецептором ЕМАР-2 цитокіну; Изучена цитокиновая активность изолированного рекомбинантного С-концевого домена тирозил-тРНК синтетазы (тирРС) млекопитающих, гомологичного ЕМАР-2 цитокину. Показано, что С-домен индуцирует увеличение хемотаксиса моноцитов в 2 раза. Этот эффект близок к таковому, вызываемому ЕМАР-2 и ргоЕМАР-2. Пратеолитически моди­фицированная каталитическая форма тирРС (2 х 39 кДа) не влияет на хемотаксис моноцитов. С-домен тир PC также индуцирует рост активности тканевого фактора эндотелиальных клеток человека в 3 раза. Предложена гипотеза относительно того, что изолированный С-домен может высвобож­даться при протеолитическом расщеплении тирРС определен­ной протеазой, активируемой в стрессовых условиях, и функ­ционировать как медиатор путем передачи сигнала при взаи­модействии с рецептором цитокина ЕМАР-2. 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/156328 Сравнительный анализ спектра кристаллических белков и плазмид ряда новых штаммов Bacillus thuringiensis Исакова, И.А.; Рымарь, С.Е.; Кузнецова, Л.Н.; Кордюм, В.А. Изучены основные характеристики ряда новых штаммов В. thuringiensis, выделенных на террито­рии Украины и проявляющих токсичность по отношению к Lepidoptera и Coleoptera (личинкам колорадского жука). Определен их плазмидный составу а также молекулярные массы кристалли­ческих инсектицидных белков, продуцируемых этими штаммами во время спекуляции.; Вивчено основні характеристики ряду нових штамів В. thuringieasis, виділених на території України, які проявляють токсичність по відношенню до Lepidoptera та Coleoptera (личинкам колорадського жука). Визначено їхній плазмідний склад, а також мопекулярні маси кристалічних інсектицидних білків, що продукуються цими штамами під час споруляції; The spectrum of insecticidal crystal proteins produced by 9 new B. thuringiensis strains isolated in Ukraine was studied. These strains demonstrated high toxicity to Lepidoptera and lower toxicity to Coleoptera (Colorado potato beettle larvae) in biological tests. It was shown that 5 strains produce high molecular weight proteins (137–164 kD), 3 strains produce 76.5 kD proteins, and one produce two proteins (96.5 kD and 77 kD). All the studied strains contain the spectrum of plasmids of both low molecular weight (less than 10 MD) and high molecular weight (more than 30 MD). The strains producing crystal proteins of similar molecular weight differ by plasmid composition. 1999-01-01T00:00:00Z