http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/114744 2026-04-09T02:36:03Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/121233 INTAS-Ukraine Workshop on Condensed Matter Physics 21 – 24 May, 1998, Lviv, Ukraine 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/120399 Master equation approach to protein folding Cieplak, M.; Henkel, M.; Banavar, J.R. The dynamics of two 12-monomer heteropolymers on the square lattice is studied exactly within the master equation approach. The time evolution of the occupancy of the native state is determined. At low temperatures, the median folding time follows the Arrhenius law and is governed by the longest relaxation time. For both good and bad folders, significant kinetic traps appear in the folding funnel and the kinetics of the two kinds of folders are quite similar. What distinguishes between the good and bad folders are the differences in their thermodynamic stabilities.; За допомогою методу керуючого рівняння точно проаналізована динаміка двох 12-мономерних гетерополімерів на квадратній гратці. Визначена часова еволюція зайнятості нативного стану. При низьких температурах середній час скручування підлягає закону Ареніуса і визначається найдовшим часом релаксації. Для білків, що добре скручуються, з’являються суттєві кінетичні пастки у наборі послідовних конформацій, у той час як для білків, що погано скручуються, пастки присутні також і в ділянках, що не відповідають нативній конформації. 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/120398 A statistical model for antibody-antigen binding Katletz, S.; Titulaer, U.M. We discuss a statistical model for antibody-antigen binding. The two macromolecules are assumed to be linked by a number of relatively weak bonds (or groups of correlated bonds) that are assumed to open and close statistically. We use the model for a preliminary analysis of experiments performed in the Institute of Biophysics at the Johannes Kepler University. In these experiments the two molecules are brought into contact using an atomic force microscope; then a prescribed time dependent force is applied to the bond and the distribution of times needed to pull the molecules completely apart is measured. This quantity is calculated with our model; its dependence on the model parameters (binding free energies, number of groups of correlated elementary bonds, force dependence of the binding free energy) is determined.; Обговорюється статистична модель, яка описує зв’язування антитіло-антиген. При цьому вважається, що дві макромолекули можуть поєднуватись через набір відносно слабих зв’язків (чи груп скорельованих зв’язків), що відкриваються і закриваються статистично. Ця модель використовується для попереднього аналізу експериментів, виконаних в Інституті біофізики Університету Йогана Кеплера. У цих експериментах дві молекули приводились у контакт, використовуючи атомної сили мікроскоп, а потім прикладалася певна залежна від часу сила до зв’язку і вимірювався розподіл часів, необхідних для повного розділення молекул. Ця характеристика розраховується з використанням запропонованої моделі; знайдена її залежність від модельних параметрів (вільних енергій зв’язування, числа груп скорельованих елементарних зв’язків, залежності вільної енергії зв’язування від сили). 1999-01-01T00:00:00Z http://dspace.nbuv.gov.ua:80/handle/123456789/120397 Physical processes in the fuel containing masses interacting with aqueous solutions in the “Shelter” object. Inhomogeneous diffusion of ions UO²⁺₂ , Cs⁺ in the system “glassy nuclear magma – water” Yukhnovskii, I.R.; Tokarchuk, M.V.; Zhelem, R.I. The influence of water on the glassy nuclear magma of the Chornobyl reactor is discussed. To describe it the simplest model for the “glassy nuclear magma–water” system is formulated. Inhomogeneous position- dependent diffusion coefficients are calculated near the interface of the system; Обговоpюється вплив води на склоподiбну ядеpну магму чоpнобильського pеактоpа. З метою теоpетичного опису pозвинуто найпpостiшу модель для системи “склоподiбна ядеpна магма – вода”. Обчислено неодноpiднi позицiйно-залежнi коефiцiєнти дифузiї бiля межi подiлу системи. 1999-01-01T00:00:00Z