Біополімери і клітина, 2005, № 5

Сендвічоподібна самоасоціація цитозину та її прояви в оптичних спектрах

2019-06-17T22:29:24Z

Сендвічоподібна самоасоціація цитозину та її прояви в оптичних спектрах Петрушко, І.А.; Суховія, М.І. З використанням багатоконфігураційної теорії самоузгодженого поля з оптимізацією геометрії в рамках гамільтоніана AM] проведено квантово-хімічне вивчення геометричних та оптичних характеристик сендвічоподібних комплексів цитозину. Аналіз довжин зв'язків, просторових кутів, частот коливальних та електронних спектрів у мономері, димері і тетрамері цитозину показує, що ці фізичні властивості молекул змінюються при комплексоутворенні. Зокрема, розрахунки демонструють високочастотний зсув валентних коливань ЯНг-групи, що узгоджується з експериментальними даними. Розподіл інтенсивностей смуг в електронних спектрах суттєво залежить від кількості молекул у комплексах цитозину. Обговорюється біофізична значущість отриманих результатів.; С использованием многоконфигурационной теории самосогласованного поля с оптимизацией геометрии в рамках гамильтониана AMI проведено квантово-химическое изучение геометрических и оптических характеристик стопочных комплексов цитозина. Анализ длин связей, пространственных углов, частот колебательных и электронных спектров в мономере, димере и тетрамере цитозина свидетельствует о том, что эти физические свойства молекул изменяются при комплексообразовании. В частности, расчеты предсказали высокочастотный сдвиг валентных колебаний МЩ-группы, что со гласуется с экспериментальными данными. Распределение интенсивностей полос в электронных спектрах зависит от количества молекул в комплексах цитозина. Обсуждается биофизическая значимость полученных результатов.; Geometrical and optical characteristics of cytosine stacking complexes have been studied by means of multi-configurational method in the frame of semiempirical Hamiltonian AM1 with full geometry optimization. An analysis of the bond lengths, spatial angles, vibration frequencies and electronic spectra in cytosine monomer, dimer and tetramer shows the changes in all aforementioned physical characteristics upon the complexing. The calculation predicts a high-frequency shift of the NH2-group valence vibrations. Intensity distribution of the electronic spectra bands of different cytosine complexes strongly depends on the number of molecules in the complex. A biophysical significance of the received results is discussed.

Ензимний кондуктометричний сенсор для визначення концентрації формальдегіду у модельних зразках

2019-06-17T22:27:34Z

Ензимний кондуктометричний сенсор для визначення концентрації формальдегіду у модельних зразках Солдаткін, О.О.; Сосовська, О.Ф.; Бенілова, І.В.; Гончар, М.В.; Корпан, Я.І. Для розробки біосенсора, чутливого до формальдегіду, використано тонкоплівкові планарні електроди і бактерійну формальдегіддегідрогеназу Pseudomonas putida. Запропоновано новий підхід до створення біоселектив ної мембрани сенсора, який дозволяє визначати концентрацію формальдегіду без використання екзогенного NAD в аналізованому зразку та проводити виміри на одному й тому ж перетворювачі без регенерації NAD через його високу (100 мМ) локальну концентрацію у мембрані. Час аналізу формальдегіду в розчині не перевищує 2 хв і 10 с у стаціонарному і кінетичному режимах вимірювання сигналів кондуктометричного біосенсора відповідно. Лінійний динамічний діапазон концентрації формальдегіду, яку можна визначити, знаходиться в межах 1–50 мМ. Досліджено залежність величини сигналу біосенсора від pH, концентрації буфера та іонної сили. Вивчено також операційну стабільність, стабільність при зберіганні і селективність створеного кондуктометричного біосенсора.; Для разработки биосенсора, чувствительного к формальдегиду, использовали тонкопленочные планарные электроды и бактериальную формальдегиддегидрогеназу Pseudomonas putida ю Предложен новый подход к созданию биоселективной, мембраны сенсора, позволяющий определять концентрацию формальдегида без использования экзогенного NAD в анализируемом образце и проводить измерения на одном и том же преобразователе без необходимости регенерации NAD из-за его высокой (100 мМ) локальной концентрации в мембране. Время анализа формальдегида не превышает 2 мин и 10 с соответственно в стационарном и кинетическом режимах измерения сигналов кондуктометрического биосенсора. Линейный динамический диапазон определяемой концентрации формальдегида находится в пределах 1—50 мМ. Исследованы зависимость величины сигнала биосенсора от рН, концентрации буфера и ионной силы, а также операционная стабильность, стабильность при хранении и селективность созданного кондуктометрического биосенсора.; Thin-film planar electrodes and formaldehyde dehydrogenase from Pseudomonas putida have been used for the development of formaldehyde-sensitive enzyme conductometric biosensor. A new approach to create a biologically active sensor membrane has been proposed. This approach allows to detect formaldehyde concentration without usage of exogenous NAD in the analyzed sample since the biomembrane contains NAD at high concentration (100 mM). Moreover, because of this the formaldehyde concentration can be measured many times with the same transducer without NAD regeneration. The time of formaldehyde analysis in the solution is no longer than 2 min and 10 s in steady-state and kinetic modes of the biosensor signal measuring, respectively. The linear dynamic range of the sensor output signals corresponds to 1–50 mM formaldehyde concentration. The optimal values of pH, buffer capacity and ionic strength have been determined. Operational stability, storage stability and selectivity of the developed conductometric biosensor have also been analyzed.

N1-Глікозидні аналоги 6-азацитидину. Цитотоксична дія та вплив на транскрипцію in vitro

2019-06-17T22:28:42Z

N1-Глікозидні аналоги 6-азацитидину. Цитотоксична дія та вплив на транскрипцію in vitro Пальчиковська, Л.Г.; Гарманчук, Л.В.; Алексєєва, І.В.; Усенко, Л.С.; Шестакова, Т.С.; Соляник, Г.І.; Швед, А.Д.; Чехун, В.Ф. На пухлинних лініях клітин епітеліального походження досліджено цитотоксичну дію низки синтезованих авторами глікозидних аналогів 6- азацитидину (6-азаС) у діапазоні концентрацій 10⁻²–10⁻⁶ М. Найвираженіший цитотоксичний ефект зафіксовано на лінії клітин раку молочної залози MCF-7. Серед досліджених сполук найефективнішим виявився ксилофуранозид 6-азацитозину, показник IC₅₀ для якого складає 0,63 ± 0,01 мМ, що у 4–7 разів менше (р < 0,05), аніж аналогічні показники для інших сполук. Виявлено здатність аналогів 6-азаС модулювати продуктивність системи транскрипції in vitro залежно від структури глікозидного фрагмента і концентрації; Исследовано цитотоксическое действие серии синтезированных авторами гликозидных аналогов 6-азацитидина в диапазоне концентраций 10⁻² –10⁻⁶ М на опухолевых линиях клеток эпителиального происхождения. Наиболее выраженный, цитотоксический эффект гликозидов зафиксирован в отношении линии клеток рака молочной железы MCF-7. Среди исследованных соединений наиболее эффективным оказался ксилофуранозид 6-азацитозина. Показатель IC₅₀ для этого гликозида равен 0,63 ± 0,01 мМ, он в 4–7 раз меньше (р< 0,05), чем аналогичный показатель для других соединений. Выявлена способность нуклеозидных аналогов модулировать продуктивность модельной системы транскрипции в зависимости от структуры гликозидного фрагмента и концентрации.; Cytotoxic action of the series of synthesized 6-azacytidine glycoside analogues in the range of 10⁻²–10⁻⁶ M on the tumor cell lines of epithelial origin has been studied. The most essential cytotoxic effect of 6-azaC analogues has been found for the MCF-7 cell line of the breast cancer. 6-Azacytosine xylofuranoside is the most effective among the compounds investigated. Index IC₅₀ for this compound is 0,63 ± 0,01 mM and it is 4–7 times less than IC50 for the other glycosides. The ability of analogues to modulate efficiency of model transcription system depending on the structure of glycosilyc fragment and concentration has been revealed.

Особливості гібридного дисгенезу в системах нестабільності у Drosophila virilis

2019-06-17T22:29:59Z

Особливості гібридного дисгенезу в системах нестабільності у Drosophila virilis Жук, О.В.; Курса, М.А.; Козерецкая, Б.В.; Козерецька, І.А. Проведено порівняльний, аналіз дисгенних схрещувань ліній, подібних до Р-М типу у D. virilis, які містять ретротранспозон Penelope. Досліджено основні показники гібридного дисгенезу у нащадків першого і другого поколінь дисгенних схрещувань, а саме: рівень редукції гонад, стерильність імаго, наявність рекомбінаційних процесів у самців та нерозходження статевих хромосом, спектр мутацій і морфозів. Виявлено присутність активних копій ретротранспозону Penelope в геномі досліджуваної лінії і продемонстровано, що наявність Penelope є необхідним, але не визначальним фактором у формуванні певної картини гібридного дисгенезу.; Проведен сравнительный анализ дисгенных скрещиваний линий Р-М-подобного типа у D. virilis, содержащих ретротранспозон Penelope. Исследованы основные показатели гибридного дисгенеза у потомков первого и второго поколений дисгенных скрещиваний, а именно: уровень редукции гонад, стерильность имаго, наличие рекомбинантных событий у самцов и нерасождение половых хромосом, спектр мутаций и морфозов. Установлено наличие активных копий ретратранспозона Penelope в геноме изучаемой линии и продемонстрировано, что присутствие Penelope является необходимым, но не определяющим фактором формирования определенной картины гибридного дисгенеза.; A comparative analysis of dysgenic traits of P-M-like strains containing retrotransposon Penelope in D. virilis was carried out. Main characteristics of hybrid dysgenesis in offsprings of the first and second generation of dysgenic traits were studied: the level of gonadal reduction, the imago sterility, the availability of recombination events in males and sex chromosomes non-disjunction, the mutations and morphosis spectrum. The presence of retrotransposon Penelope copies in the tested strain was detected and the availability of Penelope shown to be a necessary but not determinative factor in forming certain features of hybrid dysgenesis.