Біоінформаційний аналіз впливу мутацій тирозил-тРНК синтетази людини, асоційованих з нейропатією Шарко-Марі-Тус типу С, на локальні властивості її просторової структури

Abstract

Нещодавно встановлено причинний зв’язок між трьома незалежними мутаціями в гені цитоплазматичної тирозил-тРНК синтетази (TyrRS) людини і домінантною нейропатією Шарко-Марі-Тус типу C (DI-CMTС). У даній роботі для двох точкових мутацій Gly41Arg і Glu196Lys та делеції 153–156delVKQV проведено біоінформаційне дослідження впливу заміни амінокислотних залишків на локальні структурні властивості димеру каталітичного модуля TyrRS людини (2 × 39 кДа, або так звана «міні-TyrRS»), зокрема, на їхнє найближче оточення та електростатичний потенціал молекулярної поверхні білка.

A causal relationship between three independent mutant forms of the human cytoplasmic tyrosyl-tRNA synthetase (TyrRS) and dominant Charcot-Marie-Tooth neuropathy, type C, (DI-CMTC) has been recently reported . In this article we carried out the bioinformatical investigation of the effect of amino acid residues change in the cases of two point mutations Gly41Arg, Glu196Lys and deletion 153–156delVKQV on structural properties of catalytic module dimer of TyrRS (2 × 39 kDa or, so called, mini-TyrRS), especially on its local environment and electrostatic potential of molecular surface of the protein.

Недавно установлена причинная связь между тремя определенными мутантными формами цитоплазматической тирозил-тРНК синтетазы (TyrRS) человека и доминантной нейропатией Шарко-Мари-Тус типа C (DI-CMTC). В данной работе для двух точечных мутаций Gly41Arg, Glu196Lys и делеции 153–156VKQV проведено биоинформационное исследование влияния замены аминокислотных остатков на структурные особенности димера каталитического модуля TyrRS («мини-TyrRS», 2 × 39 кДа), в частности, на ее ближайшее окружение и электростатический потенциал молекулярной поверхности.